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混水小虫

金虫 (小有名气)

[求助] 分步双酶切

对质粒进行Hind III 和Sal I双酶切,因两个酶切位点离的太近(中间10个bp),请问是否应该采用分步酶切啊?
还有就是如果采用双酶切,这两个酶的酶切顺序如何确定啊?
在第一次酶切后,是不是必须要进行去磷酸化处理?看到之前的帖子上,说关于分步酶切中间的纯化步骤中,很多同学都没有说去磷酸化处理这个环节,是不是这一环节可以省略啊?
纯化方法哪个较好些啊?有些同学说是要电泳再割胶回收,有的说不电泳直接乙醇沉淀法回收,也有的人说不电泳直接加入溶胶buffer,开始回收!
请熟知这一方面的大虾给点帮助吧!
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期待,美好的生活!!
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混水小虫

金虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by czdaeq at 2012-11-30 10:16:57
楼主,我帮你查了一下,一般载体的多克隆位点区域中,SalI与HindIII的识别位点差距都在15个bp以上,同时翻阅酶的说明书,查得一般10bp以上的双酶切不存在同时双切效率损失的问题,一般甚至4bp以上的距离都能保持50% ...

谢谢你的解答。那按照你所说,在酶切中同时加上去磷酸化酶,进行酶切。这是对双酶切吗?双酶切没有必要加吧?
期待,美好的生活!!
15楼2012-11-30 11:58:16
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天空2011

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉回收两次样品损失太多,先试试双酶切呗,多切一会试试,我的相隔33bp切开了。再说就不能换换酶切位点吗?
2楼2012-11-29 21:58:32
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ben1147

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
10个bp不短了,不用分步,直接一次双酶切

双酶切载体不会自连,不用去磷酸化
3楼2012-11-29 22:35:54
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

10bp不短,注意SalI这个酶不怎么好用,多切一会吧
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2012-11-29 22:41:57
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