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Cllair

金虫 (小有名气)

[求助] pcr实验相关

我想从青霉里面克隆菊粉酶基因,之前退火在42度的时候做出来过,但是觉得条带浅没有回收,但是不知道为什么后来重复了几百组实验都没有在做出来过。引物的Tm值是51.65,我从40到60度来来回回的试了很多遍了。为什么会做不出来了呢?麻烦大家江湖急救一下,给的指导吧。
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有今生没来世,且行且珍惜。
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
18楼: Originally posted by Cllair at 2012-12-04 12:28:41
原始序列已经拿到了,就是从起始密码到终止密码的序列,单从序列看他引物设计没有问题,基因库中该属的基因就两个,一个是前体一个是基因,他是根据基因的序列设计的。我想知道前体和基因什么差别,是不是能按照前 ...

前体只是没有经过修饰的。既然两个序列都有,为什么不比对下用保守区设计呢?
20楼2012-12-05 08:28:57
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catmihzh

木虫 (小有名气)

虫虫特攻队队长

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能是模板问题,不纯或者是降解了也可能是引物降解了,如果重新制备模板和稀释引物后还p不出来,建议尝试降落pcr

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
[url=http://weibo.com/2152924384?s=6uyXnP][img]http://service.t.sina.com.cn/widget/qmd/2152924384/13d43368/7.png[/img][/url]
2楼2012-11-29 00:23:34
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bloodwar

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
再就是增加循环数,用好的酶
3楼2012-11-29 05:06:16
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种情况,果断重新设计引物。类似情况多次发生在我们实验室,引物不够特异或质量不好很容易造成这种情况
4楼2012-11-29 08:54:21
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