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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

[求助] 为何CTAB法提取的DNA总是断裂? 已有1人参与

最近一直提取的植物总DNA总是断裂,使用的是自己配制的溶液,用改良的CTAB法,提取过程已经很小心了,没有剧烈震荡,可是总是提到断裂的DNA 是什么原因呢?下图是我提的DNA 跑的0.8%琼脂糖凝胶电泳!急希望各位虫虫帮忙解答!

IMG_20121123_103631.jpg
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haha
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

引用回帖:
35楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-30 17:09:08
我们今天刚第一次提取 跑胶15min 迁移速率很小 条带非常亮 而且最下面根本没有常见的RNA“弥散条带”
估计你方法有问题 都把RNA提出来了 DNA那么大跑胶是应该很慢慢的吧...

1,称0.2-0.5g叶于预冷的研钵中快速研磨(研磨中加有10mg左右的PVP),研细后加入1ml的提取缓冲液(100mmol/l Tris-Hcl,50mmol/ledta,700mmol/lNacl,2%巯基乙醇,2%PVP)摇匀,在冰上静置10min.
2,取出离心管5000r/min 10min,去上清,加1ml预热的裂解缓冲液(100mmol/l Tris-Hcl,20mmol/ledta,1.4mol/lNacl,2%巯基乙醇,2%PVP,4%CTAB)混匀,于65度水浴锅中水浴1h,期间轻轻颠倒混匀数次。
3,取出离心管冷却至室温,12000r/mim 10min离心。
4,将上清转入新的离心管中加等体积的氯仿/异戊醇混匀,12000r/mim 10min离心。
5,去上清加等体积的酚/氯仿/异戊醇,混匀,12000r/mim 10min离心。
6,将上清转入新的离心管中加等体积的氯仿/异戊醇混匀,12000r/mim 10min离心。
7,取上清,加入100ul5mol/lNacl,再加2倍体积预冷的无水乙醇,颠倒混匀。放入-20度冰箱静止30min后,12000r/mim 10min离心。
8,沉淀用70%,及无水乙醇各洗两次,各10min 左右。
9,风干后加TE溶解,加0.5ml(0.5ulRNA酶)的TE溶解,55度放置1h,加入等体积的氯仿/异戊醇抽提1次,12000r/min,10min,再加1/3体积异丙醇及2倍体积无水乙醇(均预冷)沉淀-20度放置30min看不到沉淀,12000r/min离心后还是没有
haha
36楼2012-11-30 17:26:33
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shuishui007

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
??是DNA断裂,是????大,RNA没消化,太多了。上???是DNA,下???分??????的2-3???带是RNA,用RNase消化一下就??会有了。???外,DNA沉淀???,4000-6000rpm离心??????。
2楼2012-11-24 20:48:19
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shuishui007

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不是DNA断裂,是RNA没消化。上面的一条带是DNA,下面2-3条带是RNA,RNase消化一下就没有了。另外DNA沉淀后用4000-6000rpm离心就可以了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-11-24 20:52:44
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by shuishui007 at 2012-11-24 20:52:44
不是DNA断裂,是RNA没消化。上面的一条带是DNA,下面2-3条带是RNA,RNase消化一下就没有了。另外DNA沉淀后用4000-6000rpm离心就可以了。

谢谢,那我加RNA酶是一下!
haha
4楼2012-11-25 14:12:31
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