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swimmingcrab

铜虫 (小有名气)

[求助] 3’ RACE

请问下3‘-RACE PCR产物测序后怎么判断序列已经到3'末端了呢?
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drxiao2005

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swimmingcrab: 回帖置顶 2012-11-23 08:47:07
swimmingcrab: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-11-23 08:47:19
3'RACE产物的PolyA可能是反转录引物引入的。
通常反转录引物中的polyT会与mRNA的PolyA退火,从而起始反转录反应,并引入polyT远端的heel序列。
但并不能100%保证polyT不会与mRNA上短的A窜(A10或A5TA3)退火。
因此,3'RACE产物的PolyA通常表示mRNA的末端,但并不能100%确定。

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7楼2012-11-22 14:47:43
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
真核生物的mRNA的3端是有PolyA的存在的
2楼2012-11-21 12:13:19
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sgs8725

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把你的测序结果去载体,跟你的中间片段拼接起来,然后看后面有没有一串A
3楼2012-11-21 13:04:19
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swimmingcrab

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-11-21 12:13:19
真核生物的mRNA的3端是有PolyA的存在的

那这段polyA 大约要多少个呢? 我的有是有,但是搜一下被认为是载体序列,连接时的载体序列里面也有一串A么?
4楼2012-11-22 08:54:35
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