| 查看: 3746 | 回复: 13 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
细菌种属的鉴定（系统发育树）--急用
|
||
我对筛选的一个菌的16SrRNA测序后，然后建了个系统发育树，但是我的菌在树根的最枝头上（如图），请问这这个菌的种属怎么确定啊？谢谢！ 14.jpg  14-2.jpg [ Last edited by moucheng on 2012-11-20 at 10:56 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
93BebMhtakh前后11位开头都是大写
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有86人回复
-
感觉是下周放榜了
已经有11人回复
-
filecode=后面第一个是大写字母
已经有10人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有4人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有15人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有9人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
13楼2013-03-28 15:15:40
andywang6137
木虫 (著名写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1552.5
- 散金: 309
- 红花: 25
- 帖子: 1651
- 在线: 460.3小时
- 虫号: 607807
- 注册: 2008-09-20
- 专业: 食品加工技术
2楼2012-11-20 16:29:02
莲池梵音
金虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1708.3
- 散金: 15
- 红花: 4
- 帖子: 304
- 在线: 26.5小时
- 虫号: 820447
- 注册: 2009-08-02
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
moucheng: 金币+3, ★有帮助, 谢谢！ 2012-11-20 23:03:55
zhang8826857: 金币+3, good 2012-11-24 16:34:28
感谢参与，应助指数 +1
moucheng: 金币+3, ★有帮助, 谢谢！ 2012-11-20 23:03:55
zhang8826857: 金币+3, good 2012-11-24 16:34:28
|
单纯从你的树来看：1外群还有很多选择可改进，2 内群有点稍微盲目了，从你选的种类来看，种类多且都是每个种一个序列，这样固然可以增加种类丰度，但是在建树时却不利形成有效分枝。建议可以选择与Bicallus同一个科内的属或者其他作为外群；内群上每一个种尽量大于一个序列，其次根据相似性，几个有代表性的种，并不是种类越多越好。 PS： 请问你在NCBI进行相似性比对后 有相似性100%或者说大于97%以上的吗？如果有又是什么种类，是哪些种类？这样应该对你确定它是什么 有参考. |
3楼2012-11-20 22:15:01
4楼2012-11-20 23:09:17
