应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 衣康酸分子Dmol优化不收敛
51/1返回列表
查看: 1224  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

[交流] 衣康酸分子Dmol优化不收敛

我用MS4.4de DMol板块 对衣康酸分子进行结构优化，但是总是不收敛，故此请教各位，并想知道对于有机分子结构计算相关泛函的选择，可能PWC, PBE 或者BLYP有所差别，但不知差别在什么地方，望指点一二，多谢！
具体设置如下：
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-005或6
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                260
Opt_max_displacement          0.3000 A
Initial_hessian               improved
Symmetry                      off
Max_memory                    2048

# Electronic parameters
Spin_polarization             unrestricted
Spin                          0
Charge                        1
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    pwc
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006或5
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_spin_mixing               0.5000
Scf_iterations                50
Scf_diis                      6 pulay

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties
Plot                          homo
Plot                          lumo
Frequency_analysis            on
Grid                          msbox  3 0.2500 0.1500 0.1500 3.0000
f              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
df    C   -17.479087  22.136574 -14.386086    -0.000134   0.000150  -0.000114
df    H   -17.933020  22.130248 -16.410848    -0.000033   0.000015   0.000010
df    C   -14.781174  22.810176 -13.730020     0.000082  -0.000003   0.000134
df    C   -14.705412  24.313897 -11.291762     0.000068  -0.000068  -0.000182
df    O   -12.371556  24.388011 -10.360756     0.000017   0.000034  -0.000017
df    C   -13.447738  20.262231 -13.511478    -0.000041   0.000030  -0.000098
df    C   -15.572269  18.543939 -13.100146     0.000068  -0.000219   0.000056
df    O   -17.745771  19.487749 -13.542248     0.000002  -0.000022   0.000119
df    H   -12.026556  20.152453 -11.990008     0.000018  -0.000006  -0.000022
df    O   -15.336897  16.255639 -12.374571     0.000049   0.000016   0.000107
df    H   -16.972973  15.361828 -12.238572     0.000029  -0.000014  -0.000031
df    H   -12.469026  19.671826 -15.264037    -0.000019   0.000007  -0.000010
df    H   -12.384962  25.452674  -8.833094     0.000021   0.000001  -0.000016
df    O   -16.533657  25.312412 -10.375907    -0.000086   0.000068   0.000072
df    H   -18.853663  23.252880 -13.294013    -0.000012   0.000004   0.000006
df    H   -13.908764  23.996148 -15.203003    -0.000027   0.000006  -0.000013

C5H6O4-1.gif
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-11-18 19:31:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by qingshan0709 at 2013-12-19 09:02:48
Opt_iterations这个在哪里设置？

Opt_iterations就是几何优化的最大步数。
不太建议按照上面所说的，有些体系mix越大收敛越快，振荡体系减小mix可以减小振荡。好像昨天和你说过。
赞一下 回复此楼
8楼2013-12-20 06:06:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
jianying8996(金币+1): 谢谢参与
jianying8996: 金币+5, 谢谢，非常感谢！ 2012-11-20 08:55:55
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-19 20:56:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
jianying8996: 金币+4, 谢谢！这个还没试过，我还不知道他们的作用！ 2012-11-20 09:05:25
忘了提醒下面这两个
Scf_charge_mixing             0.2000     设置小点，可以明显加快收敛速度
Scf_spin_mixing                 0.5000     设置小点，可以明显加快收敛速度
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-20 08:58:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-11-19 20:56:05
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点

嗯，我弄好了，初始结构不合理，这是自己手动画的，CC键长太长。
而且这么不精确地设置导致收敛非常困难，初始结构很重要啊！
非常感谢你的建议！
另外问你一个问题，在MS dnp 下这个SCF迭代和Opt有什么区别啊？是电子结构优化和力场之间的关系吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-20 09:03:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +25 hualkop 2026-04-12 27/1350 2026-04-19 01:58 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 291求调剂 +10 关忆北. 2026-04-14 10/500 2026-04-18 23:32 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-16 11/550 2026-04-17 22:34 by chixmc
[考博] 求博导｜生物质基多孔碳/超级电容方向，已有相关成果，寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿沪9，生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 297，工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[基金申请] RY：中国产出的科学垃圾论文，绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +9 lzmk 2026-04-14 10/500 2026-04-15 20:02 by 学员JpLReM
[考研] 药学求调剂 +11 RussHu 2026-04-12 13/650 2026-04-15 19:07 by zhuwenxu
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 293求调剂 +16 我爱高数高数爱� 2026-04-12 18/900 2026-04-13 21:47 by 学员JpLReM
[考研] B区0809 ，数一英一，290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭