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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 衣康酸分子Dmol优化不收敛
汕头大学海洋科学接受调剂
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jianying8996

木虫 (著名写手)

[交流] 衣康酸分子Dmol优化不收敛

我用MS4.4de DMol板块 对衣康酸分子进行结构优化，但是总是不收敛，故此请教各位，并想知道对于有机分子结构计算相关泛函的选择，可能PWC, PBE 或者BLYP有所差别，但不知差别在什么地方，望指点一二，多谢！
具体设置如下：
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-005或6
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                260
Opt_max_displacement          0.3000 A
Initial_hessian               improved
Symmetry                      off
Max_memory                    2048

# Electronic parameters
Spin_polarization             unrestricted
Spin                          0
Charge                        1
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    pwc
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006或5
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_spin_mixing               0.5000
Scf_iterations                50
Scf_diis                      6 pulay

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties
Plot                          homo
Plot                          lumo
Frequency_analysis            on
Grid                          msbox  3 0.2500 0.1500 0.1500 3.0000
f              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
df    C   -17.479087  22.136574 -14.386086    -0.000134   0.000150  -0.000114
df    H   -17.933020  22.130248 -16.410848    -0.000033   0.000015   0.000010
df    C   -14.781174  22.810176 -13.730020     0.000082  -0.000003   0.000134
df    C   -14.705412  24.313897 -11.291762     0.000068  -0.000068  -0.000182
df    O   -12.371556  24.388011 -10.360756     0.000017   0.000034  -0.000017
df    C   -13.447738  20.262231 -13.511478    -0.000041   0.000030  -0.000098
df    C   -15.572269  18.543939 -13.100146     0.000068  -0.000219   0.000056
df    O   -17.745771  19.487749 -13.542248     0.000002  -0.000022   0.000119
df    H   -12.026556  20.152453 -11.990008     0.000018  -0.000006  -0.000022
df    O   -15.336897  16.255639 -12.374571     0.000049   0.000016   0.000107
df    H   -16.972973  15.361828 -12.238572     0.000029  -0.000014  -0.000031
df    H   -12.469026  19.671826 -15.264037    -0.000019   0.000007  -0.000010
df    H   -12.384962  25.452674  -8.833094     0.000021   0.000001  -0.000016
df    O   -16.533657  25.312412 -10.375907    -0.000086   0.000068   0.000072
df    H   -18.853663  23.252880 -13.294013    -0.000012   0.000004   0.000006
df    H   -13.908764  23.996148 -15.203003    -0.000027   0.000006  -0.000013

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1楼 2012-11-18 19:31:25
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
jianying8996(金币+1): 谢谢参与
jianying8996: 金币+5, 谢谢，非常感谢！ 2012-11-20 08:55:55
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点
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2楼2012-11-19 20:56:05
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
jianying8996: 金币+4, 谢谢！这个还没试过，我还不知道他们的作用！ 2012-11-20 09:05:25
忘了提醒下面这两个
Scf_charge_mixing             0.2000     设置小点，可以明显加快收敛速度
Scf_spin_mixing                 0.5000     设置小点，可以明显加快收敛速度
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3楼2012-11-20 08:58:34
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jianying8996

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-11-19 20:56:05
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点

嗯，我弄好了，初始结构不合理，这是自己手动画的，CC键长太长。
而且这么不精确地设置导致收敛非常困难，初始结构很重要啊！
非常感谢你的建议！
另外问你一个问题，在MS dnp 下这个SCF迭代和Opt有什么区别啊？是电子结构优化和力场之间的关系吗？
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4楼2012-11-20 09:03:16
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jianying8996

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-11-20 08:58:34
忘了提醒下面这两个
Scf_charge_mixing             0.2000     设置小点，可以明显加快收敛速度
Scf_spin_mixing                 0.5000     设置小点，可以明显加快收敛速度

charge 在这里代表的是整个分子的电荷吗？程序默认分子存在电荷还是其他的意思？不懂，请指教一下啊！
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5楼2012-12-01 11:47:20
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jianying8996

木虫 (著名写手)
Scf_iterations                50
跳到500就好了
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6楼2012-12-06 10:54:22
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匿名


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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7楼2013-12-19 09:02:48
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by qingshan0709 at 2013-12-19 09:02:48
Opt_iterations这个在哪里设置？

Opt_iterations就是几何优化的最大步数。
不太建议按照上面所说的，有些体系mix越大收敛越快，振荡体系减小mix可以减小振荡。好像昨天和你说过。
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8楼2013-12-20 06:06:38
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匿名


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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9楼2013-12-22 11:23:51
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