应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 衣康酸分子Dmol优化不收敛
51/1返回列表
查看: 1583  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)

[交流] 衣康酸分子Dmol优化不收敛

我用MS4.4de DMol板块 对衣康酸分子进行结构优化，但是总是不收敛，故此请教各位，并想知道对于有机分子结构计算相关泛函的选择，可能PWC, PBE 或者BLYP有所差别，但不知差别在什么地方，望指点一二，多谢！
具体设置如下：
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-005或6
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                260
Opt_max_displacement          0.3000 A
Initial_hessian               improved
Symmetry                      off
Max_memory                    2048

# Electronic parameters
Spin_polarization             unrestricted
Spin                          0
Charge                        1
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    pwc
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006或5
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_spin_mixing               0.5000
Scf_iterations                50
Scf_diis                      6 pulay

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties
Plot                          homo
Plot                          lumo
Frequency_analysis            on
Grid                          msbox  3 0.2500 0.1500 0.1500 3.0000
f              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
df    C   -17.479087  22.136574 -14.386086    -0.000134   0.000150  -0.000114
df    H   -17.933020  22.130248 -16.410848    -0.000033   0.000015   0.000010
df    C   -14.781174  22.810176 -13.730020     0.000082  -0.000003   0.000134
df    C   -14.705412  24.313897 -11.291762     0.000068  -0.000068  -0.000182
df    O   -12.371556  24.388011 -10.360756     0.000017   0.000034  -0.000017
df    C   -13.447738  20.262231 -13.511478    -0.000041   0.000030  -0.000098
df    C   -15.572269  18.543939 -13.100146     0.000068  -0.000219   0.000056
df    O   -17.745771  19.487749 -13.542248     0.000002  -0.000022   0.000119
df    H   -12.026556  20.152453 -11.990008     0.000018  -0.000006  -0.000022
df    O   -15.336897  16.255639 -12.374571     0.000049   0.000016   0.000107
df    H   -16.972973  15.361828 -12.238572     0.000029  -0.000014  -0.000031
df    H   -12.469026  19.671826 -15.264037    -0.000019   0.000007  -0.000010
df    H   -12.384962  25.452674  -8.833094     0.000021   0.000001  -0.000016
df    O   -16.533657  25.312412 -10.375907    -0.000086   0.000068   0.000072
df    H   -18.853663  23.252880 -13.294013    -0.000012   0.000004   0.000006
df    H   -13.908764  23.996148 -15.203003    -0.000027   0.000006  -0.000013

C5H6O4-1.gif
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2012-11-18 19:31:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2013-12-19 09:02:48
已阅   申请1ST强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页
查看全部 9 个回答

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
jianying8996(金币+1): 谢谢参与
jianying8996: 金币+5, 谢谢，非常感谢！ 2012-11-20 08:55:55
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-19 20:56:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
jianying8996: 金币+4, 谢谢！这个还没试过，我还不知道他们的作用！ 2012-11-20 09:05:25
忘了提醒下面这两个
Scf_charge_mixing             0.2000     设置小点，可以明显加快收敛速度
Scf_spin_mixing                 0.5000     设置小点，可以明显加快收敛速度
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-20 08:58:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianying8996

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-11-19 20:56:05
Scf_iterations                50这个太小了，设到最大1000
还有这个Opt_iterations                260 也要再弄大点

嗯，我弄好了，初始结构不合理，这是自己手动画的，CC键长太长。
而且这么不精确地设置导致收敛非常困难，初始结构很重要啊！
非常感谢你的建议！
另外问你一个问题，在MS dnp 下这个SCF迭代和Opt有什么区别啊？是电子结构优化和力场之间的关系吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-20 09:03:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭