24小时热门版块排行榜    

查看: 1722  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kuan1989

木虫 (正式写手)

[求助] 求教NCBI上BLAST的知识

在NCBI上进行序列比对以后,出来很多结果,这些结果会按照一定的顺序(相似度)排列,请高人指点Max score,        Total score        ,Query coverage,        E value,        Max ident        Links  。该如何解读?如何参考这些指数的大小?
回复此楼
太多璀璨的,越隔着夜色,越光芒四射!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1220608920

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 可以详解一下 2012-11-17 09:55:20
我个人认为Max ident是最有参考价值的
3楼2012-11-16 20:38:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

seamas_gao

金虫 (小有名气)

兴废栽桐虫

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 鼓励 2012-11-17 09:55:06
1949stone: 可以详细说一下啊 普及啊 2012-11-17 09:55:36
E value 是越小越相似,相它是越大越相似,links不用管
努力栽种梧桐树~
2楼2012-11-16 16:22:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuan1989

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by seamas_gao at 2012-11-16 16:22:30
E value 是越小越相似,相它是越大越相似,links不用管

请问这几个参数都是什么意思,怎么理解?
太多璀璨的,越隔着夜色,越光芒四射!
4楼2012-11-17 09:38:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kuan1989: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-11-17 22:37:37
Max score,        Total score        ,Query coverage,        E value,        Max ident        Links
Max score是最大的得分,就是字节数,比如8个碱基相同,那就是就是16.
E value 是期望值,
Query coverage是相同碱基占总数的百分比,
max identity 是最大相同度,这个和max score基本一致,出入不是太大
links我不太知道
希望对你有帮助。
coasttocoast。
5楼2012-11-17 10:29:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:40 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:52 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见