| 查看: 1551 | 回复: 6 | ||
kuan1989木虫 (正式写手)
|
[求助]
求教NCBI上BLAST的知识
|
| 在NCBI上进行序列比对以后，出来很多结果，这些结果会按照一定的顺序（相似度）排列，请高人指点Max score， Total score ，Query coverage， E value， Max ident Links 。该如何解读？如何参考这些指数的大小？ |
回复此楼» 猜你喜欢
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有147人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有3人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求教关于基因和对应蛋白的一个问题，困扰我很久，寄托万能的虫友
已经有1人回复
seamas_gao
金虫 (小有名气)
兴废栽桐虫
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2645.7
- 散金: 747
- 红花: 1
- 帖子: 164
- 在线: 47小时
- 虫号: 863174
- 注册: 2009-10-05
- 性别: GG
- 专业: 水产生物遗传育种学
2楼2012-11-16 16:22:30
1220608920
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 1961.2
- 帖子: 385
- 在线: 129.2小时
- 虫号: 1334152
- 注册: 2011-06-29
- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2012-11-16 20:38:51
kuan1989
木虫 (正式写手)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 4548.3
- 散金: 8
- 帖子: 353
- 在线: 147.8小时
- 虫号: 1384223
- 注册: 2011-08-30
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
4楼2012-11-17 09:38:57
tupac225
金虫 (正式写手)
- MolEPI: 5
- 应助: 103 (高中生)
- 金币: 1967.9
- 散金: 20
- 红花: 4
- 帖子: 460
- 在线: 175.3小时
- 虫号: 1533370
- 注册: 2011-12-11
- 性别: GG
- 专业: 免疫生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kuan1989: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-11-17 22:37:37
感谢参与，应助指数 +1
kuan1989: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-11-17 22:37:37
|
Max score， Total score ，Query coverage， E value， Max ident Links Max score是最大的得分，就是字节数，比如8个碱基相同，那就是就是16. E value 是期望值， Query coverage是相同碱基占总数的百分比， max identity 是最大相同度，这个和max score基本一致，出入不是太大 links我不太知道 希望对你有帮助。 |
5楼2012-11-17 10:29:25
|
楼主大人~看您发这个帖子是在2012年，过去很久啦，我也有同样的问题。 经过了4年，帖子里的问题你是不是已经清楚啦？ 可不可以指导下： 1.Max score，Total score，Query coverage， E value， Max ident Links 。该如何解读？如何参考这些指数的大小？ 哪个指数更重要？ 2.“Query cover”值和“Ident”值都相等，但是结果却不相同，有时候是同属的不同种，有时候甚至不同属，这种情况应该怎么处理？ 有时候“Query cover”值很高但是“Ident”值低，或者“Query cover”值很低但是“Ident”值高，这种情况下该优先考虑按个值呢？ 3.BLAST结果的自动排列顺序是按什么来的？自动排列顺序的先后有参考价值么？ |
6楼2016-11-17 08:19:55
xiaoshaozi22
新虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2557.6
- 散金: 200
- 红花: 1
- 帖子: 354
- 在线: 39.6小时
- 虫号: 3619818
- 注册: 2014-12-30
- 专业: 神经生物学
7楼2016-11-18 01:10:15
5