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kuan1989木虫 (正式写手)
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求教NCBI上BLAST的知识
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| 在NCBI上进行序列比对以后，出来很多结果，这些结果会按照一定的顺序（相似度）排列，请高人指点Max score， Total score ，Query coverage， E value， Max ident Links 。该如何解读？如何参考这些指数的大小？ |
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2楼2012-11-16 16:22:30
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kuan1989: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-11-17 22:37:37
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Max score， Total score ，Query coverage， E value， Max ident Links Max score是最大的得分，就是字节数，比如8个碱基相同，那就是就是16. E value 是期望值， Query coverage是相同碱基占总数的百分比， max identity 是最大相同度，这个和max score基本一致，出入不是太大 links我不太知道 希望对你有帮助。 |
5楼2012-11-17 10:29:25
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楼主大人~看您发这个帖子是在2012年，过去很久啦，我也有同样的问题。 经过了4年，帖子里的问题你是不是已经清楚啦？ 可不可以指导下： 1.Max score，Total score，Query coverage， E value， Max ident Links 。该如何解读？如何参考这些指数的大小？ 哪个指数更重要？ 2.“Query cover”值和“Ident”值都相等，但是结果却不相同，有时候是同属的不同种，有时候甚至不同属，这种情况应该怎么处理？ 有时候“Query cover”值很高但是“Ident”值低，或者“Query cover”值很低但是“Ident”值高，这种情况下该优先考虑按个值呢？ 3.BLAST结果的自动排列顺序是按什么来的？自动排列顺序的先后有参考价值么？ |
6楼2016-11-17 08:19:55
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