应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求教NCBI上BLAST的知识
71/1返回列表
查看: 1447  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

kuan1989

木虫 (正式写手)

[求助] 求教NCBI上BLAST的知识

在NCBI上进行序列比对以后，出来很多结果，这些结果会按照一定的顺序（相似度）排列，请高人指点Max score，        Total score        ，Query coverage，        E value，        Max ident        Links  。该如何解读？如何参考这些指数的大小？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
太多璀璨的，越隔着夜色，越光芒四射！
1楼 2012-11-16 16:15:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seamas_gao

金虫 (小有名气)

兴废栽桐虫

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 鼓励 2012-11-17 09:55:06
1949stone: 可以详细说一下啊 普及啊 2012-11-17 09:55:36
E value 是越小越相似，相它是越大越相似，links不用管
赞一下 回复此楼
努力栽种梧桐树~
2楼2012-11-16 16:22:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1220608920

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 可以详解一下 2012-11-17 09:55:20
我个人认为Max ident是最有参考价值的
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-16 20:38:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuan1989

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by seamas_gao at 2012-11-16 16:22:30
E value 是越小越相似，相它是越大越相似，links不用管

请问这几个参数都是什么意思，怎么理解？
赞一下 回复此楼
太多璀璨的，越隔着夜色，越光芒四射！
4楼2012-11-17 09:38:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kuan1989: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2012-11-17 22:37:37
Max score，        Total score        ，Query coverage，        E value，        Max ident        Links
Max score是最大的得分，就是字节数，比如8个碱基相同，那就是就是16.
E value 是期望值，
Query coverage是相同碱基占总数的百分比，
max identity 是最大相同度，这个和max score基本一致，出入不是太大
links我不太知道
希望对你有帮助。
赞一下(1人) 回复此楼
coasttocoast。
5楼2012-11-17 10:29:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

米夏girl

铜虫 (小有名气)
楼主大人~看您发这个帖子是在2012年，过去很久啦，我也有同样的问题。
经过了4年，帖子里的问题你是不是已经清楚啦？
可不可以指导下：
1.Max score，Total score，Query coverage，  E value，  Max ident Links  。该如何解读？如何参考这些指数的大小？
哪个指数更重要？
2.“Query cover”值和“Ident”值都相等，但是结果却不相同，有时候是同属的不同种，有时候甚至不同属，这种情况应该怎么处理？
有时候“Query cover”值很高但是“Ident”值低，或者“Query cover”值很低但是“Ident”值高，这种情况下该优先考虑按个值呢？
3.BLAST结果的自动排列顺序是按什么来的？自动排列顺序的先后有参考价值么？
赞一下 回复此楼
6楼2016-11-17 08:19:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoshaozi22

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 米夏girl at 2016-11-17 08:19:55
楼主大人~看您发这个帖子是在2012年，过去很久啦，我也有同样的问题。
经过了4年，帖子里的问题你是不是已经清楚啦？
可不可以指导下：
1.Max score，Total score，Query coverage，  E value，  Max ident Link ...

专业的人员都很难搞懂

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-11-18 01:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kuan1989 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 一志愿郑大070303，338分，求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。，。，。，。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀！ 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭