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ym6104

金虫 (小有名气)

[求助] PCR跑胶成这样。。。请各位大侠帮我看看,坐等回复。。

做基因克隆,目的片段1100bp,PCR体系25μl:DNTP  4μL,buffer 2.5μL,引物各 1μL,模版DNA 1μL(用试剂盒提的,浓度在50-80ng/μL),TAKARA LA taq  0.25 μL,ddH2O 15.25 μL。PCR反应程序为;94℃ 5min,94℃ 30s,65℃ 30s, 72℃ 1min,72℃ 7min,40个循环。1.2%的琼脂糖,100V,50min。2000的marker。切胶回收把所有的都加上了。之前扩得很顺利,这一阵不知道怎么回事,就是出不来了,有的话条带也很浅,拖尾十分严重。。以为是模版的问题,又重新提了DNA,把酶、引物还有缓冲液都换过一遍了,结果还是一样,,现在实验停滞不前了,望各位高手帮我分析分析找找解决办法。。。。。

1.png上面为DNA的编号,每个样本P了两管。



2.png



4.png之前跑的正常的图片
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ym6104

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
27楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2012-11-16 09:04:41
不知道楼主的问题有没有解决呢?我前段时间也是一直出现这种情况,我也是试过很多次了,还是找不到原因,综合我试过的实验,我怀疑是引物出现了问题。。。

今天用新设计的引物重新做了一下,这次成功了,十分感谢。。
41楼2012-11-16 17:27:40
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乐乐3952

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-15 18:56:09
ym6104: 金币+5, 有帮助 2012-11-15 20:24:31
以前也碰到p不出来的情况,后来用primer star 扩出来了,楼主的buffer用的是GC buffer I还是LA自带的那个buffer,我一般用前面那个GC的,效果还不错。还有就是循环数可以稍微减少点,你加的酶不是很多,到后面都不够了。祝好运

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

一花一世界、一叶一菩提
2楼2012-11-15 16:11:34
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ym6104

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 乐乐3952 at 2012-11-15 16:11:34
以前也碰到p不出来的情况,后来用primer star 扩出来了,楼主的buffer用的是GC buffer I还是LA自带的那个buffer,我一般用前面那个GC的,效果还不错。还有就是循环数可以稍微减少点,你加的酶不是很多,到后面都不够 ...

我用的是自带的buffer,加的东西是按他说明书上加的,之前这么做一直没什么问题,现在怎么都不行了。。。下次试试减少循环数吧。十分感谢
3楼2012-11-15 16:24:09
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review

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ym6104: 金币+5, 有帮助 2012-11-15 20:24:49
ym6104: 回帖置顶 2012-11-16 17:30:41
引物的问题   换个引物
交流
4楼2012-11-15 16:28:37
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