应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 范德华能量分解到小分子的每个原子上
192/2返回列表上一页12
查看: 1479  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

倩430

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-11-17 19:44:20
"把i与其他原子的vdw能量加起来"请问这个怎么实现啊？有相关的命令吗？教程没有看到啊。另外，计算某个原子对VDW的贡献有什么意义啊？谢谢。初学动力学，若有理解错误，请见谅...

我也是初学，我看到一篇文献是用了这个方法，想试下可是人家用的是gromacs，如果你也用这个软件也可以想04说的那样，试下
赞一下 回复此楼
11楼2012-11-18 10:51:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
11楼: Originally posted by 倩430 at 2012-11-18 10:51:46
我也是初学，我看到一篇文献是用了这个方法，想试下可是人家用的是gromacs，如果你也用这个软件也可以想04说的那样，试下...

能否把这篇文章发我，谢谢，592930344
赞一下 回复此楼
为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
12楼2012-11-18 19:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倩430

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 043114076 at 2012-11-15 12:02:39
需要修改amber的代码，然后重新编译运行...

这个问题我还没有解决。，请问用VMD可以解决吗。望指条明路吧
赞一下 回复此楼
13楼2012-12-06 22:55:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 043114076 at 2012-11-15 21:38:45
说了这么多，一点金币都没有，没诚意
闪人

帅哥，别闪，回答的好，金币版主给。哈哈哈
赞一下 回复此楼
14楼2012-12-06 23:45:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 倩430 at 2012-12-06 22:55:45
这个问题我还没有解决。，请问用VMD可以解决吗。望指条明路吧...

vmd 应该没有这个功能
赞一下 回复此楼
15楼2012-12-07 09:17:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倩430

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 043114076 at 2012-12-07 09:17:50
vmd 应该没有这个功能...

那完了，amber编译根本不会。
赞一下 回复此楼
16楼2012-12-10 10:29:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倩430

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-06 23:45:23
帅哥，别闪，回答的好，金币版主给。哈哈哈...

一般回答我问题的，都给了呢。应该是我忘记了呢。ps版主的头像我人人上用的一样
赞一下 回复此楼
17楼2012-12-10 10:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 倩430 at 2012-12-10 10:32:02
一般回答我问题的，都给了呢。应该是我忘记了呢。ps版主的头像我人人上用的一样...

哈哈哈，爱美之心人皆有之
赞一下 回复此楼
18楼2012-12-10 10:35:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuxm03

金虫 (小有名气)
vmd有这个功能，NAMDEnergy可以用，最好用命令的，不要用gui的，ok
赞一下 回复此楼
19楼2013-01-02 08:29:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 倩430 的主题更新
192/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利，还能抢救一下吗？ +5 13108017953 2026-09-21 5/250 2026-09-27 16:46 by Leogzhya
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +3 zju2000 2026-09-26 3/150 2026-09-27 16:26 by lala1008
[硕博家园] 上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生 +5 oxidpl 2026-09-20 7/350 2026-09-27 10:43 by Equinoxhua
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:42 by 4IW0sJvtEqX8
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:26 by 4IW0sJvtEqX8
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:21 by 4IW0sJvtEqX8
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:15 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:03 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 oeyPlfmMUpOC 2026-09-26 3/150 2026-09-27 09:13 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
[教师之家] 课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:37 by oxidpl
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭