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2008ynu

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何platon-squeese计算MOF溶剂个数?

RT.
看了小木虫的帖子还是不太清楚怎么计算溶剂个数。我的数据具体如下:
数据解完之后残余Q峰都在0.47一下,但checkcif后有 PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure  。然后用 squeese处理了,有:

N: Total Potential Solvent Accessible Void Vol ..................  2924.7 Ang^3
N: Electron Count / Cell =    844 - To be included in D(calc), F000 & Mol.Wght.   
怎么计算溶剂分子个数啊?溶剂是  DMF, 可能引入了非常少量的水和乙醇. 还有分子式溶剂怎么加上去啊?
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2008ynu

铁虫 (小有名气)

自己顶一个。
还有例子上说:In this case, 6 molecules of CH2Cl2 in each unit cell is a good choice for an Electron Count of 251 and a Total Potential Solvent Accessible Void Vol of 1714.1 e-/Å3 since each CH2Cl2 molecule has 42 electrons and ~200 e-/Å3 volume. Write down 6 molecules of CH2Cl2.
怎么确定是CH2Cl2的?6个是否用1714.1除251 约等于6?
2楼2012-11-14 11:46:30
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hxr8086

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 鼓励回帖交流,欢迎常来晶体板块 2012-11-15 09:26:17
Accessible Void Vol of 1714.1  除以该晶体空间群内等效点的个数6 再除以ch2cl2的电子数42等于6个ch2cl2分子,但实际上这个数据仅供参考,不一定准。
3楼2012-11-14 15:06:46
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2008ynu

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hxr8086 at 2012-11-14 15:06:46
Accessible Void Vol of 1714.1  除以该晶体空间群内等效点的个数6 再除以ch2cl2的电子数42等于6个ch2cl2分子,但实际上这个数据仅供参考,不一定准。

该晶体空间群内等效点的个数? 这个等效点个数和空间群有关吗? 251没有用吗,菜鸟一个 。能帮忙看我的是多少吗?我的是P2(1)2(1)2(1). 电子数: 水10,乙醇26,DMF39. 先谢了
4楼2012-11-14 15:33:49
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2008ynu

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hxr8086 at 2012-11-14 15:06:46
Accessible Void Vol of 1714.1  除以该晶体空间群内等效点的个数6 再除以ch2cl2的电子数42等于6个ch2cl2分子,但实际上这个数据仅供参考,不一定准。

哪位大侠来帮我分析分析啊 不甚感激!
5楼2012-11-15 08:39:41
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hxr8086

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hxr8086 at 2012-11-14 15:06:46
Accessible Void Vol of 1714.1  除以该晶体空间群内等效点的个数6 再除以ch2cl2的电子数42等于6个ch2cl2分子,但实际上这个数据仅供参考,不一定准。

我写错了,应该是251 除以该晶体空间群内等效点的个数(他的应该是1) 再除以ch2cl2的电子数42等于6个ch2cl2分子,但实际上这个数据仅供参考,不一定准。
6楼2012-11-15 09:29:19
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hxr8086

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2008ynu: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-11-15 16:39:22
2008ynu: 金币+5 2012-11-19 08:31:02
引用回帖:
4楼: Originally posted by 2008ynu at 2012-11-14 15:33:49
该晶体空间群内等效点的个数? 这个等效点个数和空间群有关吗? 251没有用吗,菜鸟一个 。能帮忙看我的是多少吗?我的是P2(1)2(1)2(1). 电子数: 水10,乙醇26,DMF39. 先谢了...

844除以p212121空间群等效点个数4再除以比方说dmf39等于5.4个dmf
7楼2012-11-15 09:32:43
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2008ynu

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by hxr8086 at 2012-11-15 09:32:43
844除以p212121空间群等效点个数4再除以比方说dmf39等于5.4个dmf...

算得5.4个dmf,那就是在原来基础上加上5.4个dmf就行了? 这个是否还要热重来辅助确定?
8楼2012-11-15 16:42:31
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hxr8086

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 2008ynu at 2012-11-15 16:42:31
算得5.4个dmf,那就是在原来基础上加上5.4个dmf就行了? 这个是否还要热重来辅助确定?...

要热重来辅助确定
9楼2012-11-17 11:18:03
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