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xiaoyangyulv金虫 (小有名气)
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【求助】急！如何使用platon计算包含偏差的氢键 已有5人参与
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怎么样用platon计算氢键呢？刚刚学了一下，可是得到了没有偏差呀？应该怎么获得准确的氢键偏差呢？还有platon可以计算pi-pi的距离，可是也没有偏差呀？这个是我刚刚得到的数据： (Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [ ARU ] D - H H...A D...A D - H...A A..H..A* A'..H..A" Sum\(XY,YZ\) Sum\(XZ\))s (------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------)s ( 1 1 O1 --H1WA ..O4 [ 2665.01] 0.80 1.96 2.7379 164)s ( 2 Intra 1 O1 --H1WB ..N5 [ ] 0.87 2.01 2.7610 145)s ( 3 1 N4 --H4 ..O5 [ 1565.01] 0.86 1.98 2.8386 177)s ( 4 1 N6 --H6 ..O4 [ 1545.01] 0.86 1.96 2.8233 176)s ( )s ( 5 1 C7 --H7 ..O2 [ 2666.01] 0.93 2.56 3.3077 137)s ( )s 谢谢帮忙！！ |
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2楼2010-06-26 09:03:20
yunruirui
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3楼2010-06-26 11:23:36
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4楼2010-06-26 20:30:54
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帝夫:感谢回帖交流！ 2010-06-29 01:01:50
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我试了，还是没有偏差呀，难道需要什么命令么？下面是我刚刚计算得到的，或者是我那里没有操作明白呢？ (Cg\(I\) Res\(I\) Cg\(J\) [ ARU\(J\)] Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S Alpha Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp Slippage)s ( )s (Cg1 [ 1] -> Cg1 [ 2666.01] 5.2113 0.6484-0.1448-0.7474 -3.0743 0.00 48.71 48.71 3.439 3.439 3.915)s (Cg1 [ 1] -> Cg2 [ 2666.01] 4.4657 0.6481-0.1632-0.7438 -3.1546 1.07 39.27 39.26 3.458 3.457)s |
8楼2010-06-27 17:23:53
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帝夫:感谢回帖交流！ 2010-06-29 01:01:56
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我试了，还是没有偏差呀，难道需要什么命令么？下面是我刚刚计算得到的，或者是我那里没有操作明白呢？ (Cg\(I\) Res\(I\) Cg\(J\) [ ARU\(J\)] Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S Alpha Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp Slippage)s ( )s (Cg1 [ 1] -> Cg1 [ 2666.01] 5.2113 0.6484-0.1448-0.7474 -3.0743 0.00 48.71 48.71 3.439 3.439 3.915)s (Cg1 [ 1] -> Cg2 [ 2666.01] 4.4657 0.6481-0.1632-0.7438 -3.1546 1.07 39.27 39.26 3.458 3.457)s |
9楼2010-06-27 17:28:27
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10楼2010-06-28 07:47:31