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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

[求助] 双链cDNA条带检测

大家好!我刚做了LD-PCR扩增出双链cDNA,用Thermo Scientific GeneRuler 1kb DNA ladder进行检测时,可以看到拖带,但是DNA ladder没有跑出全部条带,拖带不知大小范围。我做得是1.1%琼脂糖凝胶,电泳条件为50V,70min。我个人感觉,样3和样4的条带较好,样1的拖带不清晰,样2的条带也不太好,不知大家怎么看。此外,我想请教大家,大范围的Marker要什么样的电泳条件才能跑全条带呢?

双链cDNA电泳图.jpg
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努力,奋斗,拼搏。。。
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huangguoqing at 2012-11-02 10:15:11
个人建议,仅供参考!
1.0%琼脂糖胶(1 X TAE或0.5 X TBE),100V,由于配胶的模具不同,建议跑到前沿指示剂(溴酚蓝)至胶的2/3---4/5就可以了。个人感觉TBE跑出的结果好一点。而且低离子强度电流不会很大,电泳液 ...

谢谢帮忙!我制1.1%琼脂糖凝胶(0.5XTBE),100V电泳30min,结果也是一样,1kb DNA Ladder仍然没有没有跑全条带。电泳图如下:

电泳图.jpg

努力,奋斗,拼搏。。。
5楼2012-11-02 14:36:49
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你跑胶的电压太低,电泳时间过长。你可以加大电压跑快一些,前沿指示剂跑远一些。
2楼2012-11-02 07:16:33
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含羞草liu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-11-02 07:16:33
你跑胶的电压太低,电泳时间过长。你可以加大电压跑快一些,前沿指示剂跑远一些。

你好!是这样的,我之前电泳用过150V和100V,结果1kb DNA Ladder没有跑全条带,大的条带合在一起,看不清具体大小。我想,可能是电压太高,电泳时间太短引起的,所以又降低电压,延长时间做检测,结果仍然是这个样子......
努力,奋斗,拼搏。。。
3楼2012-11-02 09:26:09
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huangguoqing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-11-02 13:46:12
个人建议,仅供参考!
1.0%琼脂糖胶(1 X TAE或0.5 X TBE),100V,由于配胶的模具不同,建议跑到前沿指示剂(溴酚蓝)至胶的2/3---4/5就可以了。个人感觉TBE跑出的结果好一点。而且低离子强度电流不会很大,电泳液发热不明显,对DNA和EB的降解作用都会弱很多。
样2的条带也不错,swear的很正常,大片段的也较多。
4楼2012-11-02 10:15:11
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