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zxl102623银虫 (正式写手)
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[求助]
RESP电荷的处理
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大家好，我现在在算一个蛋白质，用gromacs做MD，这个蛋白中包含了2FE-2S，这个2FE-2S中的Fe原子和cys配位，为了得到它的参数，我采用gaussian09计算，简化了模型，用SCH3来取代cys残基，这里我有一点不太确定的是，这样计算得到的Fe和S的电荷参数需要做其他的处理吗？还是直接用 ？ 希望 大家指点一下！ |
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lujunyan1118
金虫 (小有名气)
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- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-26 22:32:29
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-26 22:32:29
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最好是用R.E.D算一下RESP电荷 建议使用服务器版本，教程也很全面http://q4md-forcefieldtools.org/RED/ |
2楼2012-11-26 22:25:07