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I听雨的蜗牛

新虫 (初入文坛)

[求助] 体外转录

大家好,我最近在做体外转录的时候遇到一个问题!我所需要转录的目的片段是插入到pcDNA3.0这个载体中的EcoRI这个酶切位点中,片段长度为2146bp, 我用BglII和XhoI这两个酶分别进行线性化,然后T7转录酶(fermentas)进行转录,但是无法转录得到正确大小的片段,电泳图显示转录之后的RNA条带的大小在marker500 bp的位置以下,无论是跑变性胶还是跑非变性胶都是这个结果!我尝试增加T7聚合酶的量,以及延长转录时间,转录过夜,都没有效果。但是我同时在做的另外一个片段(约500 bp),转录可以得到正确大小的条带。 请有经验的同志们分析一下可能的原因!

图.png
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machao8405

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

亲,我也在做体外转录,跑出来的目的片段也是比实际的要小很多,我用的是DNAmarker,听说DNAmarker不能指示RNA片段的大小,因为RNA存在二级结构等等,它的迁移速度受很多因素的影响
3楼2013-11-04 17:06:19
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fuweilin2013

铁虫 (初入文坛)

你好,你体外转录的RNA,这个电泳检测RNA是跑的普通的胶吗?用的是RNA mark吗?我也在做体外转录合成RNA ,不知道怎样跑电泳来检测RNA?
2楼2013-10-27 21:31:53
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