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苹果落地

金虫 (正式写手)

[求助] 计算带电氨基酸链的能量时,是不是需要把中和离子也要加上?

请教各位虫友,用gromacs计算几条带电氨基酸链的能量时,由于中和离子的存在,是不是需要把中和离子也要加上?但是这样算出的结果有问题:相同的肽链,一种是呈现电中性,另外一种是带有额外的静电荷,在计算库伦相互作用时,如果把中和离子也要考虑进去发现,带有额外静电荷的肽链的静电相互作用更强,而不是因为库伦排斥而变的更弱?
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