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CTAB法提取乳酸菌DNA后电泳图有多条带事怎么回事?
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本人用CTAB法提取乳酸菌DNA,marker右边的5个泳道是加了溶菌酶处理的菌株,为何后面会有条带?做16S是否有影响? 具体步骤如下: (1)每个离心管加1500ul培养物 (2)将上述装有培养物的离心管放入离心机离心5分钟(8000转/s) (3)弃上清,再加1500ul培养物,混匀,放入离心机离心5分钟(8000转/s) (4)弃上清,加1mLTE缓冲液与沉淀物充分混匀,离心5分钟(达到洗涤细菌沉淀物的目的) (5)弃上清,取567ulTE缓冲液置各有细菌沉淀物的小管,盖上盖子后放到震荡机上进行震荡或用移液枪吸推将其混匀 (6)加30ul10%SDS (7)加3ul20mol/L蛋白酶K,轻轻颠倒混匀 (8)放入37℃烘箱1h (9)加入100ul5mol/L的NaCL溶液,盖上盖子轻轻混匀 (10)加入80ulCTAB NaCL溶液,盖上盖子轻轻混匀 (11)65℃水浴10分钟 (12)加入800ul酚/氯仿/异戊醇,轻轻混匀(去除蛋白质和其他大分子物质) (13)12000转/s离心5分钟 (14)取上清液(上层为蛋白质,下层为苯酚)放入对应的新的离心管 (15)再次加入500ul/L酚/氯仿/异戊醇溶液 (16)再次离心5分钟 注:若15步的离心界面层的蛋白质很少且分层较明显,可省略17、18两步 (17)用移液枪取出500ul左右的上清液置对应的新的离心管,加2倍体积的无水乙醇和1/10的3mol/L NaAC (18)离心,将DNA沉淀到小管底部 (19)倒去上清液,只留底部DNA沉淀,向各管加500ul70%乙醇(洗涤DNA) (20)12000转/s离心5分钟 (21)弃上清液,晾干,重溶于30ul的TE缓冲液 (22)加入1ulRNA酶,37℃消化1小时 (23)DNA样品在-20℃保存备用 marker(3000)右边5个泳道在第6步前加入10微升10mg/mL的溶菌酶,希望各位大侠帮忙解释下,或者提供该方法不足之处,谢谢! |
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本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 2012.10.30.BMP
2012-10-30 19:12:18, 433.05 K
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