24小时热门版块排行榜    

查看: 1394  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

caochen

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 请问如何将多聚体分开

有一个pdb文件,是一个6聚体,对接的时候太卡了,想把这6聚体分开,只对接其中一个蛋白,请问什么软件可以做到?
回复此楼
祭奠
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caochen

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-10-23 22:34:19
MVD或者pymol都可以做到~呵呵~~

pymol如何做到,能详细说明下么.分数给你
祭奠
4楼2012-10-24 18:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-24 05:41:08
MVD或者pymol都可以做到~呵呵~~
2楼2012-10-23 22:34:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

candery

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流,你也可以把你选择的过程使用tcl脚本来实现,更加方便也利用下次使用 2012-10-24 09:51:45
我一般用VMD
用VMD打开一个pdb以后,在Representations 里的Selected Atoms 写上你要输出的部分,然后 Save coordinates,可以选很多输出格式。
3楼2012-10-24 08:49:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zy2376

铜虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2013-01-26 17:24:33
1.pymol打开PDB文件
2.点右下角的S,显示出序列
3.右下角倒数第三行 selecting 选择chains
4.pymol上方显示的序列前会标识出生是那条chain,此时选中单条chain的一个残基,就能选中整条链,然后删除。
5楼2013-01-25 19:10:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:17 by pswait
[考研] 340求调剂 +3 话梅糖111 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:47 by hyzs6688
[考研] 081700 调剂 267分 +9 迷人的哈哈 2026-03-23 9/450 2026-03-24 11:58 by 544594351
[考研] 求材料,环境专业调剂 +3 18567500178 2026-03-18 3/150 2026-03-23 23:50 by 热情沙漠
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +5 niko- 2026-03-22 5/250 2026-03-23 22:01 by fuyu_
[考研] 材料专硕英一数二306 +8 z1z2z3879 2026-03-18 8/400 2026-03-23 20:49 by baobaoye
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +3 SYA! 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:09 by macy2011
[考研] 考研化学308分求调剂 +7 你好明天你好 2026-03-23 8/400 2026-03-23 18:39 by macy2011
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
信息提示
请填处理意见