| 查看: 1019 | 回复: 3 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
g_dist 算分子末端距
|
|||
|
用 g_dist -f *.trr -n dist.xvg -o *.xvg -b 0 -e 1000 dist.xvg文件这样写的： [ end1] 1 [ end2 ] 358 想得到分子两端的距离，盒子大小 5 x 3 x 3 nm^3，做出分子两端原子的距离感觉不太对，有负值，并且出现如图中红线的跳动，轨迹转换的时候试过 trjconv -pbc mol 把分子放到盒子中，但依旧会出现相同的问题，请问应该如何解决，说具体点，谢谢！  g_dist示意图.jpg  g_dist.jpg |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : g_dist示意图.jpg
2012-10-22 10:58:57, 32.86 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 gromacs |
» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
考博求助
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如果计算蛋白质中N末端α-氨基及赖氨酸残基ε-氨基数目
已经有4人回复
- 请教均方末端距 高分子相对分子量 高分子链柔性关系
已经有3人回复
- 根均方末端距的平均值
已经有5人回复
- 在DPD中如何计算获得均方末端距？
已经有11人回复
- 计算引物退火温度时末端加的酶切位点计算在内吗？
已经有5人回复
送鲜花一朵 
3楼2012-10-22 17:09:00
2楼2012-10-22 11:07:52
4楼2012-11-30 16:10:37
