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魍魉人生

银虫 (小有名气)

[交流] 如何完整的研究一个基因的功能 已有4人参与

现在想研究下一个基因的功能,这个基因在人上面已经有研究了,但是在我要做的动物上还没有人做,但是有全基因组序列,那么请问我可以从哪些方面来研究这个基因的功能?分子?细胞?个体?具体可以进行哪些实验?或者有没有较全面的参考文献?
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chriscda

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-11 21:43:07
引用回帖:
4楼: Originally posted by piaoyidetian at 2012-12-05 10:29:44
我现在找到一个蛋白,我如何从基因的水平去研究?除了基因水平,我还可以从哪些角度去研究它再植物发育调控中的功能?恳求指导
...

你的意思是研究编码这个蛋白的基因的功能?
那大致包含基因的转录调控,转录后调控,翻译后修饰等等。在找到表型之前,这些还都不足以成为你研究的兴趣。我建议的第一步是了解这个基因的时间空间表达谱(转录水平和蛋白水平),从这里可以猜测基因的功能。
接下来,基因的发育生物学研究主要都从过表达、敲除或敲落或干扰或过表达显性负效突变体,然后观察表型开始(个体水平)。既然你的兴趣是发育调控,要确认此蛋白对发育有调控作用。根据蛋白的类型,如转录因子,就通过研究它结合什么DNA,结合哪些蛋白逐步细化对其功能的认识;如果是受体,是哪一类受体,它在哪里定位,结合哪些配体,自身是否跨膜,是否会转移定位,下游结合哪些蛋白;如果是酶,它结合什么底物,不一而足。
我觉得做发育生物学的研究重点是从表型出发,找到表型可能会很难,找到之后针对表型做分析,你自然会确定深入的方向。

[ Last edited by chriscda on 2012-12-5 at 11:49 ]
5楼2012-12-05 11:45:49
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chriscda

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-11 21:42:53
这个问题可大了。我觉得每个人能说一部分,但是说全了太难了,遗传学的研究方法足以写一本书。我想到这些:
应用半定量RT-PCR、定量PCR、原位杂交、免疫组化等方法了解基因的时空表达谱。知道基因什么时间在什么组织表达是了解其功能的基本。
在动物上 过表达/敲除或敲落 系统地分析表型,进一步分析机制。考虑到基因表达的时间空间特异性,这种人工的上调或下调基因表达就有了许多种时间、空间的组合,可能会得到不同的结果,当然这些结果不一定矛盾,而可以是互补的。
如果基因的功能域不清楚,可以在了解主要表型的基础上截短、缺失基因的一部分,以发现和了解各功能域的功能。
但以上方法的存在缺点。改变目的基因表达水平可能会导致一些后续变化,使生物过程偏离正常状态,从中既可以进行分析了解其功能,也可能从变化了的生物体中得到异于实际情况的错误结论。
2楼2012-12-04 12:58:51
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BXS523

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
21世纪,生命科学已经进入后基因组时代,大规模的基因功能研究正成为生命科学研究热点。
基因敲除、反义技术、基因诱导超表达、RNA干涉及生物信息学分析等技术成为基因功能研究的主要策略。
3楼2012-12-04 16:04:45
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piaoyidetian

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by chriscda at 2012-12-04 12:58:51
这个问题可大了。我觉得每个人能说一部分,但是说全了太难了,遗传学的研究方法足以写一本书。我想到这些:
应用半定量RT-PCR、定量PCR、原位杂交、免疫组化等方法了解基因的时空表达谱。知道基因什么时间在什么组 ...

我现在找到一个蛋白,我如何从基因的水平去研究?除了基因水平,我还可以从哪些角度去研究它再植物发育调控中的功能?恳求指导

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2012-12-05 10:29:44
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