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wanglang1987铜虫 (小有名气)
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[求助]
蛋白质数据库没有大豆蛋白PDB
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| 蛋白质数据库没有大豆蛋白PDB，要做大豆蛋白动力学，求大豆蛋白PDB格式文件。没有大豆蛋白就做不了吗？ |
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2楼2012-10-19 16:08:09
koalabear8655
铁虫 (初入文坛)
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- 散金: 20
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+4, I-TASSER确实不错~哈哈 2012-10-19 18:38:52
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+4, I-TASSER确实不错~哈哈 2012-10-19 18:38:52
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是啊，你要做大豆蛋白的动力学，总要知道你做的是哪一个蛋白吧（如果你自己都不知道，那就没人知道了）～～知道了你要做的蛋白序列，就可以blast一下，找找看有没有解出来晶体结构啦，如果没有完全一样的，那就看看有没有序列相似性比较高的蛋白解出来结构了。如果有的话，就可以modeller或者其他建模软件来构建模型。 如果都找不到序列相似度大于30％的结构的话就比较难办了。。要从头建模，这个难度就大了。 这里推荐一个做结构预测很好的server，I－TASSER，只要把序列放进去就好了。找模板啊，分析啊，都帮你做了。而且这个SERVER算是目前世界上准确性最好的SERVER了。 http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ |
3楼2012-10-19 17:53:08
