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shenxing325

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问20多kD的蛋白做Western可不可以用湿转?另外需要注意些什么?

如题,做了两次Western了,第二次做的时候用立春红染色的时候感觉条带看到了一些,但是结果还是没有条带,预染Marker也不清晰。这次打算用0.22um的膜来做,不知道结果会不会好一些。按理来说小分子应该用半干法,但是操作全是自己摸索的,不大会弄。半干法因为没有海绵的关系,感觉三明治貌似夹不紧啊,是不是滤纸要加多点加到很厚才行呢?请大家帮忙说说自己的经验
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royxueli

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by novodavid at 2012-10-18 09:01:48
求问你们的湿转条件?我需要转15KD的蛋白,以前是半干,反而不是很好。你们的电流,电压,时间,滤纸层数是多少呢?...

电压是100v。。如果不能恒压就恒流300mA,反正是那个biorad电源的上限了。。上下各两层滤纸,时间是1个小时
11楼2012-10-19 00:26:42
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普通回帖

shenxing325

铜虫 (小有名气)

补充一下:另外看到Western的技术手册里说,SDS会阻碍小分子蛋白和膜的结合,但是又说PVDF膜适用于有SDS存在的时候与蛋白质结合。那小分子蛋白用PVDF膜电转液里面到底要不要加SDS呢?加的话浓度多少比较合适?0.04%?0.1%?
2楼2012-10-17 21:56:31
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royxueli

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-18 18:45:47
20kd的我们都是用的湿转的,效果ok的。。丽春红染色看到的条带基本都是杂带,你要的条带是看不到的。。。。预染的maker看不到?在胶上清不清楚呢?是不是时间不够呢。。buffer没有问题吗。。半干没有做过。。不好意思了。。
3楼2012-10-18 00:43:11
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shenxing325: 金币+2, 有帮助 2012-10-18 09:07:16
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-18 18:45:57
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenxing325 at 2012-10-17 21:56:31
补充一下:另外看到Western的技术手册里说,SDS会阻碍小分子蛋白和膜的结合,但是又说PVDF膜适用于有SDS存在的时候与蛋白质结合。那小分子蛋白用PVDF膜电转液里面到底要不要加SDS呢?加的话浓度多少比较合适?0.04% ...

加不加SDS都可以转20kDa的蛋白。加的话,我的protocol里是用0.0375%。还有就是丽春红染色不如考马斯亮蓝灵敏,只能染出丰度高的蛋白。你的marker也要上很多才可以看得。你可以用prestained的marker,就不用预染直接看到了。
4楼2012-10-18 08:22:57
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novodavid

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by royxueli at 2012-10-18 00:43:11
20kd的我们都是用的湿转的,效果ok的。。丽春红染色看到的条带基本都是杂带,你要的条带是看不到的。。。。预染的maker看不到?在胶上清不清楚呢?是不是时间不够呢。。buffer没有问题吗。。半干没有做过。。不好意 ...

求问你们的湿转条件?我需要转15KD的蛋白,以前是半干,反而不是很好。你们的电流,电压,时间,滤纸层数是多少呢?
5楼2012-10-18 09:01:48
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shenxing325

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by royxueli at 2012-10-18 00:43:11
20kd的我们都是用的湿转的,效果ok的。。丽春红染色看到的条带基本都是杂带,你要的条带是看不到的。。。。预染的maker看不到?在胶上清不清楚呢?是不是时间不够呢。。buffer没有问题吗。。半干没有做过。。不好意 ...

可以可以传授一下你们做20kD蛋白的经验呢?比如说转膜电流多大,多长时间之类的
6楼2012-10-18 09:05:44
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shenxing325

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-18 08:22:57
加不加SDS都可以转20kDa的蛋白。加的话,我的protocol里是用0.0375%。还有就是丽春红染色不如考马斯亮蓝灵敏,只能染出丰度高的蛋白。你的marker也要上很多才可以看得。你可以用prestained的marker,就不用预染直接 ...

要多上几次Marker啊。。。预染的好贵,肉疼,但是试试看吧,谢谢啊
7楼2012-10-18 09:07:07
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shenxing325: 金币+2 2012-10-18 09:38:12
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-18 18:46:13
引用回帖:
6楼: Originally posted by shenxing325 at 2012-10-18 09:05:44
可以可以传授一下你们做20kD蛋白的经验呢?比如说转膜电流多大,多长时间之类的...

我用的湿转是400mA转1-1.5小时。如果大的疏水性蛋白,可以转2h。
老式的半干转移要根据胶和膜的面积(平方厘米)计算电流(mA)。新买的有些仪器可以电流可以上到1-2A,10分钟就够了。
8楼2012-10-18 09:22:08
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shenxing325

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-18 09:22:08
我用的湿转是400mA转1-1.5小时。如果大的疏水性蛋白,可以转2h。
老式的半干转移要根据胶和膜的面积(平方厘米)计算电流(mA)。新买的有些仪器可以电流可以上到1-2A,10分钟就够了。...

这么长时间都不会转过吗?我之前做的40多kD的蛋白,用200mA,1.5个小时转的效果就挺好的,所以我做20kD的这个用的是1个小时,但是就没转上。。。所以这次换了0.22的膜,打算做45min
9楼2012-10-18 09:37:49
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by shenxing325 at 2012-10-18 09:37:49
这么长时间都不会转过吗?我之前做的40多kD的蛋白,用200mA,1.5个小时转的效果就挺好的,所以我做20kD的这个用的是1个小时,但是就没转上。。。所以这次换了0.22的膜,打算做45min...

你用的是PVDF膜吗?不会转过的,NC膜的话不好说。
10楼2012-10-18 11:33:17
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