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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-08 08:03:12
引用回帖:
10楼: Originally posted by blueybz at 2012-11-05 12:52:59
请问版主,这个psf文件,就是可以和pdb一起可以生成lammps的data文件的吧?这里面的力场有哪几种啊?...

是的,你好好看看NAMD 的例子,把PSF PDB 一起倒入VMD 再转换成lammps的data文件,NAMD 只能用charmm力场。

具体怎么转换,lammps的tools里有个转换脚本,去研究一下就知道了。
11楼2012-11-05 13:50:02
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xiaoze123

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

12楼2012-11-06 10:23:47
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blueybz

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by xiaoze123 at 2012-11-06 10:23:47
其实对于lammps的data文件的生成方法很多,比如可以利用MS建立模型,然后采用lammps自带的msi2lmp工具就可以方便的转换啦。
不过大部分的data文件,都可以自己编程生成的

楼主,推荐个编程语言吧,好学又比较实用的
13楼2012-11-07 12:18:44
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xiaoze123

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

14楼2012-11-07 16:58:44
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blueybz

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
谢谢楼主,我准备学matlab
15楼2012-11-08 06:05:59
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