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lxhlxh052c木虫 (著名写手)
小木虫之无虫
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[求助]
过渡态能量问题(站内搜了没有找到类似的情况)
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目前在做只涉及一个C-H键断裂，另一个新C-H键生成的反应机理。反应过程为: GS---TS1---IM---TS2---FS. 使用gaussian03，b3lyp/6-31+g(d)进行的计算。首先对反应键的键长进行了扫描。得到了两个能量局部最高点。针对两个最高点的结构，使用TS寻找过渡态，得到TS1，TS2两个过渡态，每个过渡态只有一个虚频，且振动方式合理。经IRC验证趋势合理，TS1优化能得到GS及IM1,TS2优化能够得到IM2及FS。并且IM1和IM2的能量和结构可认为没有区别，为同一物质。 但是在比较能量的时候发现TS2的能量小于IM的能量。。如下图（所有的能量都是sum elec & zpe.）  怀疑是TS2的结构有问题，重新寻找TS2，以IM1（能量稍小于IM2）为反应物，FS为产物，旧的TS2为猜想的过渡态，使用QST3方法重新寻找，得出的TS2(new)的能量还是低于IM，IRC验证趋势合理，结构优化还没有跑完，估计也能得到IM和FS。 程序都是正常结束的，结构也都是想要的结果，为什么TS2的能量就低了呢。。。前辈们有没有遇到这种情况啊。TS的能量就必须的低于反应物的吗？我的这个反应TS2的能量是稍小于IM。。 迷茫了。。 也不知道我把问题说明白了没有。。 [ Last edited by lxhlxh052c on 2012-10-15 at 18:43 ] |
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 高斯计算总结 | 过渡态计算 | 计算化学 |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
lxhlxh052c: 金币+9, ★★★★★最佳答案 2012-10-17 18:13:56
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lxhlxh052c: 金币+9, ★★★★★最佳答案 2012-10-17 18:13:56
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所有的能量都是sum elec & zpe. 如果不包含zpe时，IM低于TS2就可以。 这个情况我们遇到很多了。以下文献供参考。 Y.-X. Zhao, X.-N. Wu, J.-B. Ma, S.-G. He and X.-L. Ding, J Phys Chem C 114 (28), 12271-12279 (2010). J.-B. Ma, X.-N. Wu, Y.-X. Zhao, X.-L. Ding and S.-G. He, Phys Chem Chem Phys 12, 12223-12228 (2010). X.-N. Wu, Y.-X. Zhao, W. Xue, Z.-C. Wang, S.-G. He and X.-L. Ding, Phys Chem Chem Phys 12, 3984-3997 (2010). |
2楼2012-10-16 22:14:22
