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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯能量计算收敛问题，化学反应过渡态能垒图
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虎毛

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯能量计算收敛问题，化学反应过渡态能垒图

大家好，新手又来提问了，希望得到各位大侠的指点。我先在UB3LYP/6-31G( d) 优化的基础上, 采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算各驻点的节点能和零点能，但是正常结束后，四个收敛条件全是NO，这样的输出结果还准确吗？我发现结果和文献中的有一点点出入。输入文件是：
%Chk=CON2-E.chk
%Mem=1700MB
#P rb3lyp/6-31G(d) Opt(CalcFC,TS,noeigen,maxcyc=500)  scf=maxcyc=500

C+N2O-CO+N2

0 1
C1                                               
O2        C1        1.3000                               
N4        O2        2.6000        C1        90.0000               
N3        N4        1.3000        O2        0.0000        C1        -180.0000

--Link1--
%Chk=CON2-E.chk
%Mem=1700MB
#T QCISD(T)/6-311G(d,P)  Freq Guess=Read Geom=AllCheck
过渡态的结构优化四个条件都是YES，但是后面freq求能量就不行了，该怎么加强收敛呢？试过SCF=tight，QC，maxcyc=500等，好像都不管用。
还有一个问题就是，做出来的化学反应过渡态能垒图，我怎么才能知道它对不对呢，比如说有没有一个能量变化趋势什么的，比如过渡态的能量要比反应物或者生成物的低啥的，抱歉没有化学基础，各位大侠给小弟指点一下啊！
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1楼2012-07-24 10:24:14
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回帖置顶 ( 共有1个 )

虎毛

木虫 (正式写手)
虎毛: 回帖置顶 2012-07-24 14:33:38
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangth0921 at 2012-07-24 12:52:48
B3LYP平衡结构不等于QCISD(T)平衡结构，在非平衡结构的基础上计算频率没有意义。况且，QCISD(T)频率计算，没有解析梯度，你就慢慢等吧！

高手，请慢走。我是看其他文献上，包括我师兄的毕业论文，他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀？还有那个解析梯度，是加入相关关键词吗？高手赐教一下吧，我现在确实太菜了。
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3楼2012-07-24 14:21:11
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

dreamyeye

木虫 (著名写手)
一般来说过渡态能量要高于反应物和产物，没有基础最好先多看看这个方向的文献，搞清楚自己工作的意义和研究的方法。
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6楼2012-07-24 22:14:06
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wangth0921

铁虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
虎毛: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢热心回帖 2012-07-24 14:21:54
B3LYP平衡结构不等于QCISD(T)平衡结构，在非平衡结构的基础上计算频率没有意义。况且，QCISD(T)频率计算，没有解析梯度，你就慢慢等吧！
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2楼2012-07-24 12:52:48
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36xuliang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
虎毛: 金币+1, ★有帮助, 没有毕业论文，只有发表的一篇和毕业论文差不多的 2012-07-24 23:06:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 14:21:11
高手，请慢走。我是看其他文献上，包括我师兄的毕业论文，他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀？还有那个解析梯度，是加入相关关键词 ...

请问你师兄的毕业论文是什么，能发给我看看吗？想学习一下，谢谢了邮箱liangxuxuxu@126.com
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4楼2012-07-24 21:39:30
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chembetsey

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 14:21:11
高手，请慢走。我是看其他文献上，包括我师兄的毕业论文，他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀？还有那个解析梯度，是加入相关关键词 ...

还真是第一次看见低水平优化的结构，高水平算零点能的。。。

童鞋你确定你师兄以及其他文献是QCISD(T)算的零点能，不是UB3LYP的零点能么？
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5楼2012-07-24 21:49:22
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BQ20110430

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
虎毛: 金币+1, ★有帮助, 多谢顶帖 2012-07-24 23:06:47
这个。。。不是很懂啦，大家会的都出来帮一下啊
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7楼2012-07-24 22:51:29
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虎毛

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chembetsey at 2012-07-24 21:49:22
还真是第一次看见低水平优化的结构，高水平算零点能的。。。

童鞋你确定你师兄以及其他文献是QCISD(T)算的零点能，不是UB3LYP的零点能么？...

是啊，我确定。原文如下“对反应过程中的反应物、过渡态、中间体和产物在B3LYP/6-31G (d) 水平上进行优化，在此基础上采用QCISD(T )/6-311G (d ，p) 方法计算出所研究反应的反应通道上各驻点的节点能和零点能．”还有其他相关文献也是这么说的。我们是工科的热能工程专业，和量子化学方面差的太远，可能不太专业？高手给指点一下吧
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8楼2012-07-24 23:05:06
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chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
虎毛: 金币+3, ★★★很有帮助, 多谢回帖 2012-07-25 10:23:13
引用回帖:
8楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 23:05:06
是啊，我确定。原文如下“对反应过程中的反应物、过渡态、中间体和产物在B3LYP/6-31G (d) 水平上进行优化，在此基础上采用QCISD(T )/6-311G (d ，p) 方法计算出所研究反应的反应通道上各驻点的节点能和零点能．”还 ...

好吧。。。我只能说从量化的角度来说，没道理这么干的。也不知道是不是第一个人这么做了之后，后面的人就都照着干了。。。问问你师兄看他怎么说吧。

节点能这个说法也是第一次听说。我想应该是单点能吧。

你可以考虑用QCISD(T)的单点能加上B3LYP的零点能（ZPE）作为高水平的能量。这个能量一般应该是过渡态比反应物产物高的。

你写的专业是燃烧学，不知道你是不是做那种燃烧机理模型的。
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虎毛
9楼2012-07-25 02:47:49
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虎毛

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by chembetsey at 2012-07-25 02:47:49
好吧。。。我只能说从量化的角度来说，没道理这么干的。也不知道是不是第一个人这么做了之后，后面的人就都照着干了。。。问问你师兄看他怎么说吧。

节点能这个说法也是第一次听说。我想应该是单点能吧。

你 ...

多谢帮忙。我翻看了下其他文献，最早的几篇都是B3LYP/6-31G (d) 水平上优化，QCISD(T )/6-311G (d ，p) 方法计算节点能。但是最近的几篇文献确实改变了，统一用B3LYP/6-31G (d) 优化和求节点能，或者在 B3LYP/3-21G*上优化几何构型．在 B3LYP/6-31G (d ) 水平上计算单点能。可能之前的不太科学。如果用B3LYP/6-31G (d)求能量，我就不清楚该用四个里面的哪个能量做势垒图了，可否给点意见？
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10楼2012-07-25 10:38:16
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