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虎毛

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯能量计算收敛问题,化学反应过渡态能垒图

大家好,新手又来提问了,希望得到各位大侠的指点。我先在UB3LYP/6-31G( d) 优化的基础上, 采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算各驻点的节点能和零点能,但是正常结束后,四个收敛条件全是NO,这样的输出结果还准确吗?我发现结果和文献中的有一点点出入。输入文件是:
%Chk=CON2-E.chk
%Mem=1700MB
#P rb3lyp/6-31G(d) Opt(CalcFC,TS,noeigen,maxcyc=500)  scf=maxcyc=500

C+N2O-CO+N2

0 1
C1                                               
O2        C1        1.3000                               
N4        O2        2.6000        C1        90.0000               
N3        N4        1.3000        O2        0.0000        C1        -180.0000

--Link1--
%Chk=CON2-E.chk
%Mem=1700MB
#T QCISD(T)/6-311G(d,P)  Freq Guess=Read Geom=AllCheck
过渡态的结构优化四个条件都是YES,但是后面freq求能量就不行了,该怎么加强收敛呢?试过SCF=tight,QC,maxcyc=500等,好像都不管用。
还有一个问题就是,做出来的化学反应过渡态能垒图,我怎么才能知道它对不对呢,比如说有没有一个能量变化趋势什么的,比如过渡态的能量要比反应物或者生成物的低啥的,抱歉没有化学基础,各位大侠给小弟指点一下啊!
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dreamyeye

木虫 (著名写手)

一般来说过渡态能量要高于反应物和产物,没有基础最好先多看看这个方向的文献,搞清楚自己工作的意义和研究的方法。
6楼2012-07-24 22:14:06
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普通回帖

wangth0921

铁虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
虎毛: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢热心回帖 2012-07-24 14:21:54
B3LYP平衡结构不等于QCISD(T)平衡结构,在非平衡结构的基础上计算频率没有意义。况且,QCISD(T)频率计算,没有解析梯度,你就慢慢等吧!
2楼2012-07-24 12:52:48
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虎毛

木虫 (正式写手)

虎毛: 回帖置顶 2012-07-24 14:33:38
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangth0921 at 2012-07-24 12:52:48
B3LYP平衡结构不等于QCISD(T)平衡结构,在非平衡结构的基础上计算频率没有意义。况且,QCISD(T)频率计算,没有解析梯度,你就慢慢等吧!

高手,请慢走。我是看其他文献上,包括我师兄的毕业论文,他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀?还有那个解析梯度,是加入相关关键词吗?高手赐教一下吧,我现在确实太菜了。
3楼2012-07-24 14:21:11
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36xuliang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
虎毛: 金币+1, 有帮助, 没有毕业论文,只有发表的一篇和毕业论文差不多的 2012-07-24 23:06:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 14:21:11
高手,请慢走。我是看其他文献上,包括我师兄的毕业论文,他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀?还有那个解析梯度,是加入相关关键词 ...

请问你师兄的毕业论文是什么,能发给我看看吗?想学习一下,谢谢了邮箱liangxuxuxu@126.com
4楼2012-07-24 21:39:30
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chembetsey

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 14:21:11
高手,请慢走。我是看其他文献上,包括我师兄的毕业论文,他们都是先在UB3LYP/6-31G( d) 上优化, 在采用QCISD( T) / 6-311G( d, p) 方法计算节点能和零点能。那我应该怎么做呀?还有那个解析梯度,是加入相关关键词 ...

还真是第一次看见低水平优化的结构,高水平算零点能的。。。

童鞋你确定你师兄以及其他文献是QCISD(T)算的零点能,不是UB3LYP的零点能么?
5楼2012-07-24 21:49:22
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BQ20110430

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
虎毛: 金币+1, 有帮助, 多谢顶帖 2012-07-24 23:06:47
这个。。。不是很懂啦,大家会的都出来帮一下啊
7楼2012-07-24 22:51:29
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虎毛

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by chembetsey at 2012-07-24 21:49:22
还真是第一次看见低水平优化的结构,高水平算零点能的。。。

童鞋你确定你师兄以及其他文献是QCISD(T)算的零点能,不是UB3LYP的零点能么?...

是啊,我确定。原文如下“对反应过程中的反应物、过渡态、中间体和产物在B3LYP/6-31G (d) 水平上进行优化,在此基础上采用QCISD(T )/6-311G (d ,p) 方法计算出所研究反应的反应通道上各驻点的节点能和零点能.”还有其他相关文献也是这么说的。我们是工科的热能工程专业,和量子化学方面差的太远,可能不太专业?高手给指点一下吧
8楼2012-07-24 23:05:06
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chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
虎毛: 金币+3, ★★★很有帮助, 多谢回帖 2012-07-25 10:23:13
引用回帖:
8楼: Originally posted by 虎毛 at 2012-07-24 23:05:06
是啊,我确定。原文如下“对反应过程中的反应物、过渡态、中间体和产物在B3LYP/6-31G (d) 水平上进行优化,在此基础上采用QCISD(T )/6-311G (d ,p) 方法计算出所研究反应的反应通道上各驻点的节点能和零点能.”还 ...

好吧。。。我只能说从量化的角度来说,没道理这么干的。也不知道是不是第一个人这么做了之后,后面的人就都照着干了。。。问问你师兄看他怎么说吧。

节点能这个说法也是第一次听说。我想应该是单点能吧。

你可以考虑用QCISD(T)的单点能加上B3LYP的零点能(ZPE)作为高水平的能量。这个能量一般应该是过渡态比反应物产物高的。

你写的专业是燃烧学,不知道你是不是做那种燃烧机理模型的。

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9楼2012-07-25 02:47:49
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虎毛

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by chembetsey at 2012-07-25 02:47:49
好吧。。。我只能说从量化的角度来说,没道理这么干的。也不知道是不是第一个人这么做了之后,后面的人就都照着干了。。。问问你师兄看他怎么说吧。

节点能这个说法也是第一次听说。我想应该是单点能吧。

你 ...

多谢帮忙。我翻看了下其他文献,最早的几篇都是B3LYP/6-31G (d) 水平上优化,QCISD(T )/6-311G (d ,p) 方法计算节点能。但是最近的几篇文献确实改变了,统一用B3LYP/6-31G (d) 优化和求节点能,或者在 B3LYP/3-21G*上优化几何构型.在 B3LYP/6-31G (d ) 水平上计算单点能。可能之前的不太科学。如果用B3LYP/6-31G (d)求能量,我就不清楚该用四个里面的哪个能量做势垒图了,可否给点意见?
10楼2012-07-25 10:38:16
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