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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 分子动力学模拟的并行计算
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ruthxu

金虫 (正式写手)

[交流] 分子动力学模拟的并行计算

各位虫友，计算机模拟计算经常也不可避免的要用到并行计算，Gromacs中并行计算方法是DD(domain decomposition）和PD  (particles decomposition)，还有现在不断发展的GPU并行。大家对并行计算了解多少？了解的同学，能不能给一些介绍，或是一些入门的参考资料，欢迎大家积极讨论，互相帮助，不断进步！
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1楼 2012-10-12 10:18:08
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
ruthxu(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-12 15:52:14
小mm你是要研究并行算法吗？

如果你要是做MD模拟，对gromacs模拟中使用DD PD不了解的话，你仔细看看gromacs手册即可，gromacs手册介绍的非常清楚了。
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2楼2012-10-12 14:23:17
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scarecrow143

至尊木虫 (著名写手)
★
ruthxu(金币+1): 谢谢参与
帮顶
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3楼2012-10-14 14:22:08
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