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ruthxu

金虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 1109.2
帖子: 319
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虫号: 1159022

[交流] 分子动力学模拟的并行计算

各位虫友，计算机模拟计算经常也不可避免的要用到并行计算，Gromacs中并行计算方法是DD(domain decomposition）和PD (particles decomposition)，还有现在不断发展的GPU并行。大家对并行计算了解多少？了解的同学，能不能给一些介绍，或是一些入门的参考资料，欢迎大家积极讨论，互相帮助，不断进步！

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1楼 2012-10-12 10:18:08

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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
ruthxu(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-12 15:52:14

小mm你是要研究并行算法吗？

如果你要是做MD模拟，对gromacs模拟中使用DD PD不了解的话，你仔细看看gromacs手册即可，gromacs手册介绍的非常清楚了。

2楼2012-10-12 14:23:17

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scarecrow143

至尊木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 2850
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虫号: 346212

★
ruthxu(金币+1): 谢谢参与

帮顶

3楼2012-10-14 14:22:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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