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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候，分子量会比本来的分子量大很多？
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lxyyzz

木虫 (小有名气)

[求助] 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候，分子量会比本来的分子量大很多？ 已有1人参与

RT，求高人解释，SDS-PAGE不是本来剔除了电荷的影响么。
另外，到底什么样的算脯氨酸“富集”？
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1楼 2012-10-09 09:52:36
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peanutshuang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

p53就是一种因为富含脯氨酸而在SDS-PAGE上显示为更大分子量的蛋白，请见维基百科：
http://en.wikipedia.org/wiki/P53

“However, based on calculations from its amino acid residues, p53's mass is actually only 43.7 kDa. This difference is due to the high number of proline residues in the protein; these slow its migration on SDS-PAGE, thus making it appear heavier than it actually is.[7]”

我也很好奇原因。
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11楼2014-11-13 10:50:06
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lxyyzz

木虫 (小有名气)
没有人知道么。。。
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2楼2012-10-10 09:01:33
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sj082csh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lxyyzz: 金币+5, ★有帮助, 谢谢回复~ 2012-10-13 09:48:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-16 13:48:55
据说是这样的：1.亲水性高，碱性蛋白，结合的SDS数目较少，因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰，所以其表观分子量较计算出的分子量大
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3楼2012-10-12 22:29:01
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lxyyzz

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sj082csh at 2012-10-12 22:29:01
据说是这样的：1.亲水性高，碱性蛋白，结合的SDS数目较少，因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰，所以其表观分子量较计算出的分子量大

关于这个问题：
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸，不属于碱性氨基酸啊；SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关？
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白，有的蛋白脯氨酸含量也很高（比如某段氨基酸序列，30个氨基酸里面有9个脯氨酸），但是就没有出现分子量偏大的现象。这种情况怎么解释？

另外还有一个问题。有的富含脯氨酸的蛋白质，纯化的结果是两条带。一条与实际分子量差不多，一条要多很多，两条带的分子量差十几kDa。WB的结果表明，这两个条带都是这个蛋白。我觉得这种现象可能跟脯氨酸有关系。请问这种现象是否也有合理的解释？
望不吝告知~
谢谢！
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4楼2012-10-13 09:59:47
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