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lhazrael

木虫 (正式写手)

[求助] 生物类的请帮忙看下审稿意见，急！！

急着毕业所以投的是biotechnology letters，不知道是为什么就给了一个审稿人的意见，下面是审稿建议：
- Using RT-PCR rather than qRT-PCR is risky and may lead to misleading results. It is unclear to me whether the gel presented in fig 1 is a representative of several independent experiments or just a one-shot test. I would strongly urge the authors to use qPCR to determine the level of RNAi in teh transpormants. The number of replicats used should be indicated for all of the data presented (not just fig 1). （实验结果的确是一次实验得到的one-shot test）
- I have the same question for the growth data. Are the pictures shown the representative of several biological replicats and if so, was there any variation in the growth for the transformants, or is this just a single experiment.
- The absence of a correlation between the effect on growth and on conidiation requires more discussion (assuming this is reproducable) and at least an hypothesis. Based on the current text the authors suggest that donwregulation of the chitin synthase results in reduced growth and conidiation, but based on the current data these effects are not linked. An explanation or hypothesis is needed.
- The correlation between expression and penicillin production also does not fit. E.g. transformants 10, 11 and 15 have similar expression as the original strain but significantly reduced production. This could again be due to an artefact of the RT-reaction, strengthening the need for qPCR.

1.实验室做分子很少，qPCR更没做过，感觉做rt-pcr已经很崩溃了，再摸索估计耗很长时间，看的相关文章也有直接做RT-PCR的，能不能绕过不做qPCR啊？
2.第一个问题中的The number of replicats是不是指实验重复次数？
3.第二个问题，我的实验数据中都有error bar的，除了菌落和菌丝照片，他为什么还这么问呢？
4.关于第三个问题，我做的实验也是参照国外的文献做的，别人的结果就这样啊，也没细讲，再说中间的关系肯定复杂的很啊，怎么回答？
5.第四个问题，影响产量的因素很多啊，我文章中有大体解释过，产量的下降跟发酵过程中的传质传氧结球有很大关系的，但因为是letters，图片数文章篇幅都有限制，不可能细讲的啊

希望高手帮忙啊，急！！

[ Last edited by lhazrael on 2012-10-7 at 14:16 ]
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1楼2012-10-07 14:12:17
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wenzonglu

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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lhazrael: 金币+8, ★★★很有帮助 2012-10-08 19:24:48
1.实验室做分子很少，qPCR更没做过，感觉做rt-pcr已经很崩溃了，再摸索估计耗很长时间，看的相关文章也有直接做RT-PCR的，能不能绕过不做qPCR啊？
RT-PCR的图片是可以的，不知道你文章是否有类似的话：PCR products were ......... photographed under ultraviolet illumination. Total gray were estimated by Glyko BandScan 4.5 for RT-PCR products, and the data were presented as the ratio of samples densitometric units to the β-actin （内参基因） units.用委婉语句说明你们实验室目前没有做定量RT-PCR条件，只能做RT-PCR，可附带2-3篇今年出版的SCI中有RT-PCR说明问题的，委婉说明RT-PCR能初步说明问题但能有定量RT-PCR更好（这个说明不能出现在正文哦，在回复编辑或审稿人的point-to-point里）。
2.第一个问题中的The number of replicats是不是指实验重复次数？v
不是实验重复次数，是定量RT-PCR的复制数。
3.第二个问题，我的实验数据中都有error bar的，除了菌落和菌丝照片，他为什么还这么问呢？
审稿人觉得你的数据（the growth data）附带的图片没有代表性（跟问题1一样，可能会是错误的结果）。对于半定量的实验方法结果里有图还要有表数据进行说明。
4.关于第三个问题，我做的实验也是参照国外的文献做的，别人的结果就这样啊，也没细讲，再说中间的关系肯定复杂的很啊，怎么回答？
很简单，讨论里你没有写好而已，根据你的结果讨论可能存在的关系，再结合2-3篇相关文献论述既可。
5.第四个问题，影响产量的因素很多啊，我文章中有大体解释过，产量的下降跟发酵过程中的传质传氧结球有很大关系的，但因为是letters，图片数文章篇幅都有限制，不可能细讲的啊
同样，讨论里你没有写好而已，根据你的结果讨论可能存在的关系，再结合2-3篇相关文献论述既可。
祝楼主早中SCI顺利毕业！
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9楼2012-10-08 14:06:48
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lhazrael

木虫 (正式写手)
lhazrael: 回帖置顶 2012-10-07 16:29:57
这个RT-PCR的结果说明不了问题吗？

Fig.1_副本.jpg
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2楼2012-10-07 16:16:04
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lijingbo

禁虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lhazrael: 金币+2, ★有帮助 2012-10-08 10:11:53
本帖内容被屏蔽
3楼2012-10-07 16:31:56
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lhazrael

木虫 (正式写手)
实在是年底毕业比较着急，如果再重新做的话就来不及了，想各位高手帮忙想想办法
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4楼2012-10-07 20:11:34
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