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[资源] 在Gaussian09计算中考虑标量相对论和旋轨耦合

在Gaussian09中,加入了一种考虑旋轨耦合相对论效应的方法DKHSO。原则上它支持所有的化学元素,只要有合适的基组。DKHSO目前仅能做Hatree-Fock级别的旋轨耦合计算。旋轨耦合DFT计算尚未充分测试,需要修改G09源代码才能执行。

下面简单说说DKHSO的执行方法。

1,标量相对论计算
默认情况下,DKHSO计算四阶Douglas-Kroll-Hess单电子标量相对论的哈密顿,文献中一般叫做DKH4,选项为Integral=DKHSO。标量DKH4可以与任何全电子的从头算和DFT方法结合使用,但不能与半经验方法和ECP混用。注意,使用DKH4的方法都没有解析梯度和解析频率,做结构优化和振动频率计算可能会非常耗时。

DKH4需要使用非收缩基组(计算非常耗时,甚至超过Gaussian程序的处理能力),或者用全电子相对论方法收缩的基组(通常用DKH2或DKH3收缩;DKH4收缩更好,但是很少见;ZORA收缩的芯轨道不佳,不要使用),用Gen关键词读入外部基组。这类基组可以在以下网站找到:

https://bse.pnl.gov/bse/portal
ANO-RCC基组,SARC-DKH,以及带DK后缀的cc-pVnZ基组
http://tyr0.chem.wsu.edu/~kipeters/basis.html
带DK后缀的基组
http://setani.sci.hokudai.ac.jp/sapporo/Welcome.do
Sapporo-DK系列和DK3-Gen-Tk系列基组
此外,Hirao等人还在DKH3-HF级别做过1-103号元素的最小基,但是没有应用价值。

如果不追求高精度,18号以下的元素(定性计算甚至可以放宽到Kr元素)也可以用一般的非相对论基组。

注意:Gaussian的DKHSO选项强制使用有限尺寸原子核模型,而以上DKH基组都是用点原子核模型收缩的,会带来微小的误差。

例:Ar原子的标量DKH4相对论Hartree-Fock计算。作为演示,这里使用非相对论基组3-21G。输入:

#p hf/3-21g int=dkhso

test

0 1
Ar

计算得到的能量为-525.857790223 a.u.

2,旋轨耦合(也叫二分量)相对论计算
在标量DKH4基础上考虑旋轨耦合,需要做复数轨道Hartree-Fock计算,选项为GHF和Int=DKHSO。

如果有Gaussian09源代码,还可以做复数轨道的 DFT计算(GB3LYP,等),只需把L502的一处出错语句注释掉。

很多年前人们就发现,单电子旋轨耦合积分和双电子旋轨耦合积分的贡献在同一数量级,缺一不可(J. Chem. Phys. 82, 5577, 1985)。但是双电子旋轨耦合积分会急剧增加计算量。Gaussian的DKHSO是一个纯单电子近似,结果会不会毫无意义呢?不用担心,这是因为,DKHSO使用了Boettger提出的单电子旋轨耦合积分屏蔽公式,可以得到与严格旋轨耦合积分计算非常接近的结果。细节参见J. Chem. Phys. 120, 5875, 2004。

例:Ar原子的二分量DKH4相对论Hartree-Fock计算。 基组同上。输入:

#p ghf/3-21g int=dkhso

test

0 1
Ar

考虑旋轨耦合以后,不再使用轨道的概念,而是使用旋量。旋量的满占据数是1。由于GHF不使用对称性,我们只能看到旋量的能量,看不到对称符号。不过,对于原子,旋量对称性(J)与旋量简并性(D)的关系为D=2J+1。根据简并性,并结合前面标量DKH4计算输出的轨道,不难猜出这些旋量的对称性依次为:1s_1/2(两个),2s_1/2(两个),2p_3/2(四个),2p_1/2(两个),等等。

        occ. eigenvalues -- -118.26821-118.26821 -12.34229 -12.34229  -9.52602
        occ. eigenvalues --   -9.52602  -9.52602  -9.52602  -9.48972  -9.48972
        occ. eigenvalues --   -1.27958  -1.27958  -0.58938  -0.58938  -0.58938
        occ. eigenvalues --   -0.58938  -0.58603  -0.58603
       virt. eigenvalues --    0.72886   0.72886   0.86389   0.86389   0.86389
       virt. eigenvalues --    0.86389   0.86772   0.86772

开壳层原子计算会破坏简并性,无法得到旋量对称性,只能去分析旋量的成分和空间分布。分子计算的情况类似。

这个计算得到的能量为-525.857816992 a.u.。和前一个计算结果比较,旋轨耦合使Ar原子的总能量下降约6个波数。

3,注意事项

以上旋轨耦合计算方法适合处理闭壳层的体系,以及非简并的开壳层体系。如果是高对称体系的简并态,以上方法得到的结果可能很差。例如碘原子。这是HF单参考波函自身的缺陷造成的。

不要把“旋轨耦合效应”与“旋轨耦合分裂”这两个概念混淆。后者是在前者的基础上,计算多个旋量态之间的能量差。DKHSO目前只能得到一个旋量态(通常是最低的),因此不能计算旋轨耦合分裂。

[ Last edited by beefly on 2012-10-6 at 09:42 ]

注意:Gaussian09所有的版本在计算DKH4旋轨耦合积分的步骤中都使用了错误的换算因子,导致旋轨耦合效应被低估,无法重复文献中的结果。需要修改源代码才能正确执行DKH4旋轨耦合计算。

[ Last edited by beefly on 2012-11-15 at 10:47 ]
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引用回帖:
7楼: Originally posted by dongwen176 at 2012-10-07 11:50:35
为什么Gaussian09计算旋轨耦合效应一定要先进行标量相对论计算,我用Molcas的计算完全不采用RCC基组,就是ANO-L基组,不过原子都很小,第二周期的,这样误差会有多大呢。本身HF的精度就不高。molcas的casscf级别计算 ...

1,有些比较轻的元素,标量相对论效应和一阶旋轨耦合都不大。这种情况一般可以忽略全部相对论效应。
例子有H2、HF的离解能。

2,有些比较轻的元素,标量相对论效应不大,但是一阶旋轨耦合比较大。这种情况可以只考虑后者。
例子有HBr的离解能。Br的旋轨耦合使离解能下降3 kcal/mol。

3,有些比较重的元素,标量相对论效应很大,但是一阶旋轨耦合很小或是0。这种情况可以只考虑前者。
例子有Hg2的离解能。

4,有些比较重的元素,标量相对论效应和一阶旋轨耦合都很大。这种情况二者都要考虑。
例子有I2的离解能。

5,Rn之后的重元素,即便一阶旋轨耦合为零,二阶旋轨耦合通常也很大,因此二者都要考虑。
8楼2012-10-07 23:28:52
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luolun2008

至尊木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好贴,
3楼2012-10-06 09:23:18
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dongwen176

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

请问高斯计算旋轨耦合常数与Molcas计算旋轨耦合常数有何区别,似乎Molcas不同的版本计算结果不是很一致,还有此处的计算式SCF水平上的,比Molcas低了一级啊
4楼2012-10-06 11:17:34
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引用回帖:
4楼: Originally posted by dongwen176 at 2012-10-06 11:17:34
请问高斯计算旋轨耦合常数与Molcas计算旋轨耦合常数有何区别,似乎Molcas不同的版本计算结果不是很一致,还有此处的计算式SCF水平上的,比Molcas低了一级啊

旋轨耦合常数全称是“旋轨耦合分裂常数”,上面说过,G09的GHF+DKHSO只能算单根,计算单个态(通常是基态)在旋轨耦合的影响下的总能量,因此不能得到旋轨耦合常数。如果复轨道方法将来能推广到CIS,TDDFT,CASSCF,等等,就有可能算旋轨耦合常数。

旋轨耦合效应受动态相关能、基组级别的影响不大,只要是适合HF描述的单参考体系就能计算。为了解决HF的总能量精度不高的问题,可以在GHF+DKHSO和HF+DKHSO级别分别计算总能量,得到旋轨耦合对总能量的校正项,叠加到其他方法的总能量上,例如CCSD/ECP。

这种方法类似于NWChem和Turbomole中的SODFT方法,不过后者是基于DFT+旋轨耦合ECP,计算量小很多。所有这些方法都不能算旋轨耦合常数。
5楼2012-10-06 21:53:32
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