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金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs使用新参数计算能量

我现在有一条长的轨迹文件。现在想使用轨迹中的结构以及新的参数计算每一步的能量。不知道怎么实现。跪求各位大神帮忙。
BTW mdrun -rerun不能用计算出来的是各种奇怪的数值。

fight

1楼 2012-09-26 15:02:52

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荣誉版主 (职业作家)

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新的参数计算每一步的能量？？？？

难道你的输出选项里没有 edr 文件吗？
这里面就是各种能量啊

2楼2012-09-26 15:18:43

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金虫 (小有名气)

xlxsioc: 回帖置顶 2012-09-26 17:08:10

引用回帖:

2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-26 15:18:43
新的参数计算每一步的能量？？？？

难道你的输出选项里没有 edr 文件吗？
这里面就是各种能量啊

有啊，我现在想用新参数重新计算能量，比较原来的edr文件能量与重新计算的能量的不同

fight

3楼2012-09-26 16:05:08

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