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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Gromacs使用新参数计算能量
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xlxsioc

金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs使用新参数计算能量

我现在有一条长的轨迹文件。 现在想使用轨迹中的结构 以及 新的参数 计算每一步的能量。不知道怎么实现。跪求各位大神帮忙。
BTW mdrun -rerun不能用 计算出来的是各种奇怪的数值。
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fight
1楼 2012-09-26 15:02:52
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
新的参数 计算每一步的能量？？？？

难道你的输出选项里没有 edr  文件吗？
这里面就是各种能量啊
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2楼2012-09-26 15:18:43
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xlxsioc

金虫 (小有名气)
xlxsioc: 回帖置顶 2012-09-26 17:08:10
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-26 15:18:43
新的参数 计算每一步的能量？？？？

难道你的输出选项里没有 edr  文件吗？
这里面就是各种能量啊

有啊，我现在想用新参数重新计算能量，比较原来的edr文件能量与重新计算的能量的不同
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fight
3楼2012-09-26 16:05:08
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