24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 503  |  回复: 2

xlxsioc

金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs使用新参数计算能量

我现在有一条长的轨迹文件。 现在想使用轨迹中的结构 以及 新的参数 计算每一步的能量。不知道怎么实现。跪求各位大神帮忙。
BTW mdrun -rerun不能用 计算出来的是各种奇怪的数值。
回复此楼

» 猜你喜欢

fight
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

xlxsioc

金虫 (小有名气)

xlxsioc: 回帖置顶 2012-09-26 17:08:10
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-26 15:18:43
新的参数 计算每一步的能量????

难道你的输出选项里没有 edr  文件吗?
这里面就是各种能量啊

有啊,我现在想用新参数重新计算能量,比较原来的edr文件能量与重新计算的能量的不同
fight
3楼2012-09-26 16:05:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
新的参数 计算每一步的能量????

难道你的输出选项里没有 edr  文件吗?
这里面就是各种能量啊
2楼2012-09-26 15:18:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xlxsioc 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 283分材料与化工求调剂 +29 罗KAKA 2026-04-02 29/1450 2026-04-03 23:56 by userper
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-02 11/550 2026-04-03 23:46 by hemengdong
[考研] 求调剂不挑专业 +3 xrh030412 2026-04-01 3/150 2026-04-03 14:40 by 氮气气气
[考研] 专硕 351 086100 也是考的材科基 本科也是材料 +8 202451007219 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:50 by 蓝云思雨
[考研] 294求调剂 +3 Grey_Ey 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:34 by swb0218
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:16 by 兔突突突,
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
[考研] 413求调剂 +3 柯某某 2026-03-31 3/150 2026-04-02 16:59 by zzsw+
[考研] 求调剂 +7 Aniyaio 2026-04-02 7/350 2026-04-02 16:42 by zzsw+
[考研] 一志愿同济大学323分(080500)求调剂 +6 yikeniu 2026-04-01 6/300 2026-04-02 14:19 by smileboy2006
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 材料化工340求调剂 +5 jhx777 2026-03-30 5/250 2026-04-02 12:45 by smileboy2006
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 354求调剂 +4 lxb598 2026-03-31 5/250 2026-04-02 09:55 by Jaylen.
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 09:52 by yulian1987
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 材料专硕306英一数二 +7 z1z2z3879 2026-03-31 7/350 2026-04-01 14:50 by ZXlzxl0425
[考研] 288资源与环境专硕求调剂,不限专业,有学上就行 +25 lllllos 2026-03-30 26/1300 2026-04-01 09:52 by 一只好果子?
[考研] 福建理工大学材料学院先进合金团队招收考研调剂学生 +3 大华金商都 2026-03-30 4/200 2026-03-31 01:04 by 方英俊602
[考研] 一志愿华中师范化学332分求调剂 +3 Lyy930824@ 2026-03-29 3/150 2026-03-30 20:15 by DHUSHUAI
信息提示
请填处理意见