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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 请教蛋白质之类的大分子模拟入门建议。。。
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亍寞

金虫 (小有名气)

[求助] 请教蛋白质之类的大分子模拟入门建议。。。

在国外的老板跟以前方向略有不同，以前是小分子量化计算，都是gaussian之类分析轨道电子计算方法等，这些关联的基础理论还算有一点点的了解。。。
但是以后的老板是算蛋白质DNA反应过程的分子动力学模拟的，现在一点基础都没有，其实连MD具体到底是啥都不知道。。。坛子上资源虽然很多但是太多了选哪一个也不知道。。。
因此，求推荐入门教材论文，各种资料链接review。。。
非常感谢各位大侠~！！！

[ Last edited by 亍寞 on 2012-9-20 at 12:10 ]
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1楼 2012-09-20 11:36:22
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亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-20 16:03:20
蛋白质DNA

首先NAMD  ,GROMACS ，上这两个官网吧，都有教程

谢谢建议！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2012-09-20 19:20:35
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
亍寞: 金币+3 2012-09-20 13:11:46
量子力学都能懂，经典力学还怕什么呢，LZ加油！
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

亍寞
理论与计算化学，化学物理，生物物理
2楼2012-09-20 12:58:44
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亍寞

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by agent99 at 2012-09-20 12:58:44
量子力学都能懂，经典力学还怕什么呢，LZ加油！

谢谢鼓励。。。自己倒是看了手头MD的书，基本的力学公式还好，但是MD里面的各种什么时间间隔之类的不同的内容还是不明白到底要怎么用。。。
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3楼2012-09-20 13:11:34
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-20 16:13:49
亍寞: 金币+10 2012-09-20 19:20:12
蛋白质DNA

首先NAMD  ,GROMACS ，上这两个官网吧，都有教程
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4楼2012-09-20 16:03:20
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