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hujiaoff金虫 (正式写手)
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[求助]
GenBnak序列提交问题
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最近提交了几个序列,回复要点如下:We have noticed that some or all of the sequences contain internal stop codons and/or reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an alignment). This generally indicates problems such as: - errors in the nucleotide sequence - sequences have not been trimmed of low quality - problems with feature annotation which may be due to: translation in the wrong reading frame or on the wrong strand translation does not have the correct exon spans translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's 序列都是双向测序,与Genbank已有的同种序列比对相似性为99%或100%,而且在填写注释时都是与已有的同种序列比对后确定的,不知为什么还会出现问题。由于是第一次接触这方面,现在不知道从哪方面入手。希望虫友不吝赐教! |
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2楼2012-12-13 11:54:43












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