应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » siesta-3.1 计算石墨烯条带不收敛，不知是不是我的输入有问题。
51/1返回列表
查看: 2935  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] siesta-3.1 计算石墨烯条带不收敛，不知是不是我的输入有问题。

大家好，我最近用siesta计算一个zigzag型石墨烯条带，宽度为16条zigzag链（16-zgnr）。可是自洽不收敛啊，我的输入结构使用vasp优化后的结构。想用siesta算电子结构。
一下是我的fdf文件：
SystemName zigzag graphene nanoribbon-16 lains
SystemLabel ZGNR16

NumberOfAtoms     34
NumberOfSpecies   2

%block ChemicalSpeciesLabel
  1    6    C
  2    1    H
%endblock ChemicalSpeciesLabel


PAO.BasisSize     DZP

LatticeConstant   1.0  Ang

%block LatticeVectors
50.000000000000000    0.0000000000000000     0.0000000000000000
0.0000000000000000     2.4676929835305224     0.0000000000000000
0.0000000000000000     0.0000000000000000    10.0000000000000000
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat  Fractional
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  0.4005863261073461  0.7635675166241384  0.5000000000000000  1
  0.4861138744030586  0.7631620370088510  0.5000000000000000  1
  0.5715306303683311  0.7652203390752147  0.5000000000000000  1
  0.6569497014874649  0.7649995785970080  0.5000000000000000  1
  0.7423983813159606  0.7636392092441970  0.5000000000000000  1
  0.8279538544680551  0.7645027036095580  0.5000000000000000  1
  0.9137570545789509  0.7656507928653636  0.5000000000000000  1
  0.3151078859472453  0.7656007593586642  0.5000000000000000  1
  0.9273615966545191  0.2658042298488465  0.5000000000000000  1
  0.3292355303324607  0.2653823675374359  0.5000000000000000  1
  0.4148299038026551  0.2630882289567006  0.5000000000000000  1
  0.5003518177665096  0.2635412543771478  0.5000000000000000  1
  0.5857451241441004  0.2652320086258215  0.5000000000000000  1
  0.6711672235607071  0.2645919901159354  0.5000000000000000  1
  0.7566318781910900  0.2636219003256479  0.5000000000000000  1
  0.8421527606483915  0.2648575848498046  0.5000000000000000  1
  0.8707644696675394  0.2653823675374359  0.5000000000000000  1
  0.2726384033454806  0.2658042298488465  0.5000000000000000  1
  0.3578472393516086  0.2648575848498046  0.5000000000000000  1
  0.4433681218089099  0.2636219003256479  0.5000000000000000  1
  0.5288327764392927  0.2645919901159354  0.5000000000000000  1
  0.6142548758558992  0.2652320086258215  0.5000000000000000  1
  0.6996481822334901  0.2635412543771478  0.5000000000000000  1
  0.7851700961973451  0.2630882289567006  0.5000000000000000  1
  0.5430502985125357  0.7650005785970054  0.5000000000000000  1
  0.7994136738926537  0.7635665166241409  0.5000000000000000  1
  0.2862429454210487  0.7656517928653611  0.5000000000000000  1
  0.3720461455319449  0.7645037036095554  0.5000000000000000  1
  0.4576016186840393  0.7636402092441945  0.5000000000000000  1
  0.8848921140527546  0.7655997593586668  0.5000000000000000  1
  0.6284693696316690  0.7652193390752172  0.5000000000000000  1
  0.7138861255969410  0.7631610370088535  0.5000000000000000  1
  0.2507856796782075  0.2675344989796367  0.5000000000000000  2
  0.9492143203217924  0.2675344989796367  0.5000000000000000  2
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1  0   0  0.0
   0  36  0  0.0
   0  0   1  0.0
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack



SolutionMethod       diagon   
ElectronicTemperature  50 meV

xc.functional         GGA           
xc.authors            PBE           
#SpinPolarized         true         
MeshCutoff           400. Ry  
MaxSCFIterations     200  
DM.MixingWeight      0.5
DM.NumberPulay       1  
DM.Tolerance         1.d-4
#SpinPolarized        .true.

#%DM.InitSpin
#9  +2.
#18 -2.
#%endblock DM.InitSpin

WriteMullikenPop  1



哪位高手帮我看一下，不胜感激！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档 good resources

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-09-17 10:49:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by redskywei at 2012-09-17 15:04:09
DM.NumberPulay       1  设置的低了点吧。
%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1  0   0  0.0                 ####这个感觉也有点小。
   0  36  0  0.0               ####这个感觉也有点大。
   0  0   1  0.0 ...

我加大了真空层，为30A在x和z方向，还是不收敛。  这么简单的体系，不应该啊。
赞一下 回复此楼
4楼2012-09-17 18:33:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 25 个回答

redskywei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小木虫于: 金币+5, ★有帮助 2012-09-17 15:15:47
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-30 18:34:01
DM.NumberPulay       1  设置的低了点吧。
%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1  0   0  0.0                 ####这个感觉也有点小。
   0  36  0  0.0               ####这个感觉也有点大。
   0  0   1  0.0
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack
MeshCutoff           400. Ry      ####感觉这个有点太大了。
还有的你晶格数据有点奇怪，真空层是否小了点，特别是y方向上。
赞一下 回复此楼
坠入无边的网~~
2楼2012-09-17 15:04:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by redskywei at 2012-09-17 15:04:09
DM.NumberPulay       1  设置的低了点吧。
%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1  0   0  0.0                 ####这个感觉也有点小。
   0  36  0  0.0               ####这个感觉也有点大。
   0  0   1  0.0 ...

y方向没有真空层，是周期性的。 x和z方向是有真空层的。MeshCutoff曾经用过200Ry，DM.numberPulay 也用过5和3都不收敛的。 我增加一下x和Z方向的真空层试一下。

多谢你的回帖！
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-17 15:11:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

redskywei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-22 10:55:53
小木虫于: 金币+3, ★有帮助 2012-10-07 08:43:50
的确有点奇怪，减小cutoff 增大DM.numberPulay  一般就可以收敛了。建议你检查一下自己的结构和晶格到底匹配不？特别是y方向，用这些参数做成图形化模型看看，有时候数字看不出。一个二维的条带应该很容易收敛的。
赞一下 回复此楼
坠入无边的网~~
5楼2012-09-17 18:53:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 25 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 人气不行了 +9 fansofjerry 2026-08-21 9/450 2026-08-24 17:48 by zhaozhengxin
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +5 scalable 2026-08-24 5/250 2026-08-24 17:03 by spiderzhuzhi
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭