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Nocturne

木虫 (正式写手)

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专业: 材料物理化学

[求助] 关于结构优化和分子能量的计算

今天我在CCDC上下载了苯甲酸甲酯的结构，因为-COOCH3和苯环不是一个平面的
角度大概为23度
所以我想算算分子能量，开始优化的时候，提示总是出错。我开始的时候固定了二面角的
由于本人刚开始学习，希望高手们指教

见下面

%chk=F:\LT.chk
--------------------------------------------------------
# opt=modredundant rb3lyp/6-311+g(d,p) geom=connectivity
--------------------------------------------------------
1/14=-1,18=120,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=4,6=6,7=111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/7=1/1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20/3(3);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=4,6=6,7=111,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4/5=5,7=1,16=3/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
-----------
CSD ENTRY 3
-----------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
Error parsing atomic flags:
  QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
PDBNAME=O1,RESNAME=UNK,RESNUM=1
'
Last state="Top"
TCursr=  144 LCursr= 0
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l101.exe at Tue Sep 11 10:09:26 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    7 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

=====================================================
%chk=F:\LT.chk
# opt=modredundant rb3lyp/6-311+g(d,p) geom=connectivity

CSD ENTRY 3

0 1
O(PDBName=O1,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.15700000 -1.12500000 7.35000000
O(PDBName=O2,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.14200000 0.99900000 6.63100000
C(PDBName=C1,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.16500000 -0.32400000 6.44700000
C(PDBName=C2,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.19800000 -0.68900000 4.99800000
C(PDBName=C3,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.15600000 1.44600000 8.00700000
H(PDBName=H3A,ResName=UNK,ResNum=1)                5.14400000 2.42600000 8.03300000
H(PDBName=H3B,ResName=UNK,ResNum=1)                5.96700000 1.11800000 8.44900000
H(PDBName=H3C,ResName=UNK,ResNum=1)                4.36600000 1.09700000 8.47100000
C(PDBName=C4,ResName=UNK,ResNum=1)                   4.75800000 -1.94600000 4.61500000
H(PDBName=H4A,ResName=UNK,ResNum=1)                4.45500000 -2.56400000 5.26900000
C(PDBName=C5,ResName=UNK,ResNum=1)                   4.75900000 -2.29900000 3.27100000
H(PDBName=H5A,ResName=UNK,ResNum=1)                4.42700000 -3.14800000 3.00200000
C(PDBName=C6,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.24600000 -1.41300000 2.32200000
H(PDBName=H6A,ResName=UNK,ResNum=1)                5.25300000 -1.65800000 1.40500000
C(PDBName=C7,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.72300000 -0.16800000 2.71200000
H(PDBName=H7A,ResName=UNK,ResNum=1)                6.08000000 0.42700000 2.06300000
C(PDBName=C8,ResName=UNK,ResNum=1)                   5.68000000 0.21000000 4.04800000
H(PDBName=H8A,ResName=UNK,ResNum=1)                5.97500000 1.07300000 4.31200000

1 3 2.0
2 3 1.5 5 1.0
3 4 1.0
4 9 2.0 17 1.5
5 6 1.0 7 1.0 8 1.0
6
7
8
9 10 1.0 11 1.5
10
11 12 1.0 13 1.5
12
13 14 1.0 15 1.5
14
15 16 1.0 17 1.5
16
17 18 1.0
18
D 17 4 3 1 F
==============================

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