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dndxwoaini新虫 (小有名气)
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[求助]
怎么样生成4M的Kcl溶液
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我用vmd的加离子插件加kcl到4M就死机了,加3M没问题。 不知大家有什么好的方法是kcl浓度到达4M? |
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-09-10 22:59:06
dndxwoaini: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-09-13 20:50:39
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dndxwoaini: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-09-13 20:50:39
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resetpsf mol load psf sin_hex.psf pdb sin_hex.pdb set conc 1.0 set water [atomselect top "name OH2"] set num [expr {int(floor($conc*[$water num]/(55.523 + 2.0*$conc) + 0.5))}] package require autoionize autoionize -psf sin_hex.psf -pdb sin_hex.pdb -nna $num -ncl $num -o sin_ions package require autoionizegui set Autoi: utprefix sin_ionsset Autoi::ksegid POT Autoi::sod2pot 你把这段例子里的脚本看明白,自己写个tcl脚本就可以了。 |
2楼2012-09-10 22:43:03
dndxwoaini
新虫 (小有名气)
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3楼2012-09-13 20:49:17












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utprefix sin_ions