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dndxwoaini

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么样生成4M的Kcl溶液

我用vmd的加离子插件加kcl到4M就死机了,加3M没问题。
不知大家有什么好的方法是kcl浓度到达4M?
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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-09-10 22:59:06
dndxwoaini: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-09-13 20:50:39
resetpsf
mol load psf sin_hex.psf pdb sin_hex.pdb
set conc 1.0
set water [atomselect top "name OH2"]
set num [expr {int(floor($conc*[$water num]/(55.523 + 2.0*$conc) + 0.5))}]
package require autoionize
autoionize -psf sin_hex.psf -pdb sin_hex.pdb -nna $num -ncl $num -o sin_ions
package require autoionizegui
set Autoi:utprefix sin_ions
set Autoi::ksegid POT
Autoi::sod2pot



你把这段例子里的脚本看明白,自己写个tcl脚本就可以了。
2楼2012-09-10 22:43:03
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dndxwoaini

新虫 (小有名气)

已经解决,谢谢
3楼2012-09-13 20:49:17
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