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1989shaonan

金虫 (小有名气)

[交流] petite list used in FoFCou 就算不动了

简单计算 Fe(H2O)6^2+结构优化，输入文件如下：

%nprocshared=4
%mem=13000MB
# opt b3lyp/gen pop=npa geom=connectivity pseudo=read

opt

2 5
Fe                -0.12104250    0.48098433    0.00000000
O                 -0.12104441    2.59087056    0.02191134
H                  0.46684397    3.07694992   -0.56093864
O                 -0.12085575    0.47005949   -2.13997211
H                 -0.15837466   -0.36291562   -2.61572919
O                  2.01495749    0.48098433   -0.00018640
H                  2.49501023   -0.08996161    0.60410666
O                 -0.12104347   -1.62898626    0.01113995
H                 -0.71650418   -2.10591610    0.59386156
O                 -0.12104250    0.48098433    2.14000000
H                 -0.94785563    0.56804785    2.62000000
O                 -2.26104250    0.48098433    0.00000000
H                 -2.74104250    1.10946415   -0.54425464
H                 -0.70893366    3.06473943    0.61473046
H                 -2.74104250   -0.14749549    0.54425464
H                  0.70577063    0.39392082    2.62000000
H                  0.47441680   -2.11204305   -0.56651325
H                  2.49490475    1.05193028   -0.60456324
H                 -0.08325306    1.29813373   -2.62420251

1 2 1.0 8 1.0 12 1.0 10 1.0 6 1.0 4 1.0
2 3 1.0 14 1.0
3
4 5 1.0 19 1.0
5
6 7 1.0 18 1.0
7
8 9 1.0 17 1.0
9
10 11 1.0 16 1.0
11
12 13 1.0 15 1.0
13
14
15
16
17
18
19

Fe 0
lanl2dz
****
O H 0
6-31+G*
****

Fe 0
lanl2dz

输出文件结尾：
Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1         26           0       -0.040085    0.003081   -0.028568
      2          8           0        0.823274    1.673757   -1.087071
      3          1           0        0.459442    2.240754   -1.790681
      4          8           0       -1.959027    0.237379   -0.980166
      5          1           0       -2.797435    0.432790   -0.523450
      6          8           0        0.735278   -1.369169   -1.496956
      7          1           0        0.561680   -2.327567   -1.533843
      8          8           0       -0.838402   -1.638590    1.102422
      9          1           0       -0.330375   -2.116613    1.783145
     10          8           0        1.898490   -0.278966    0.978750
     11          1           0        2.162321    0.086702    1.841822
     12          8           0       -0.549326    1.360989    1.562986
     13          1           0       -0.577633    2.332499    1.500466
     14          1           0        1.707747    2.020142   -0.869326
     15          1           0       -1.013588    1.112949    2.382365
     16          1           0        2.661432   -0.775366    0.632081
     17          1           0       -1.664079   -2.135992    0.961740
     18          1           0        1.139616   -1.117133   -2.347064
     19          1           0       -2.149218    0.283529   -1.934217
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      1.4115376      1.3883703      1.3648590
Basis read from rwf:  (5D, 7F)
Pseudo-potential data read from rwf file.
There are   154 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
Integral buffers will be    131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
   154 basis functions,   292 primitive gaussians,   162 cartesian basis functions
    39 alpha electrons       35 beta electrons
       nuclear repulsion energy       510.0302627399 Hartrees.
NAtoms=   19 NActive=   19 NUniq=   19 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   50 NAOKFM=F Big=F
One-electron integrals computed using PRISM.
   1 Symmetry operations used in ECPInt.
ECPInt:  NShTT=    1953 NPrTT=    9612 LenC2=    1937 LenP2D=    6998.
LDataN:  DoStor=T MaxTD1= 4 Len=   56
NBasis=   154 RedAO= T  NBF=   154
NBsUse=   154 1.00D-06 NBFU=   154
Initial guess read from the read-write file.
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.000000
         Rot=    1.000000    0.000000    0.000000    0.000000 Ang=   0.00 deg.
Initial guess orbital symmetries:
Alpha Orbitals:
       Occupied  (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A)
       Virtual   (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
Beta  Orbitals:
       Occupied  (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
       Virtual   (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
Initial guess = 0.0000 = 0.0000 = 2.0000 = 6.0285 S= 2.0057
Harris functional with IExCor=  402 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 2.20D-02 ExpMax= 5.48D+03 ExpMxC= 8.25D+02 IAcc=3 IRadAn=         0 AccDes= 0.00D+00
HarFok:  IExCor=  402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         0 IDoV= 1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=           0
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=     500 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           4 NGrid=           0.
Petite list used in FoFCou.


算到这里就不再输出了，#p发现是l402，应该是收敛问题，怀疑是初始结构不合适，初始结构的键长是文献值。
多次试着修改了输入条件和结构，可总是出现这个问题，真心求助各位大侠给予解答！谢谢！

[ Last edited by 1989shaonan on 2012-9-8 at 09:04 ]
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1楼 2012-09-07 22:46:02
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1989shaonan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by yanrding at 2012-11-09 11:27:51
这个问题解决了没有？
我也遇到这个问题了。
换一台服务器，或者换一个G09的版本，都不会错。
另外，基组包含赝势的时候才会有这个错误。

还没有解决，后来换体系了，这个问题就先搁置了
赞一下 回复此楼
8楼2012-11-10 10:25:39
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chembetsey

木虫 (小有名气)
★
1989shaonan(金币+1): 谢谢参与
什么叫算不动了？是死机了？还是Gaussian的窗口一直停在一个地方不写输出？
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-08 04:42:05
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1989shaonan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chembetsey at 2012-09-08 04:42:05
什么叫算不动了？是死机了？还是Gaussian的窗口一直停在一个地方不写输出？

linux下计算的，没有死机，计算窗口一直显示knotify，不再出现link进程，Gaussian输出文件就停在那里不再输出
赞一下 回复此楼
4楼2012-09-08 09:01:44
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yanrding

金虫 (正式写手)
★
1989shaonan(金币+1): 谢谢参与
这个问题解决了没有？
我也遇到这个问题了。
换一台服务器，或者换一个G09的版本，都不会错。
另外，基组包含赝势的时候才会有这个错误。
赞一下 回复此楼
7楼2012-11-09 11:27:51
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