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[求助]
MPI并行出错，诚心求助~~
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为了问题描述，我从最开始来： 1. 程序编译mpif77 test.f 得到a.out编译文件 2. 脚本：#!/bin/bash #PBS -l nodes=2:ppn=4 #PBS -l walltime=640:01:00 cd $PBS_O_WORKDIR mpirun ./a.out 最简单的脚本，要求不高，只要能运行。 3. 我程序中写明要输出8个文件，结果只有进程0输出文件。 4. 结果：job_mpitest.e2059这个文件显示： /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied MPI Application rank 0 exited before MPI_Init() with status 0 5. 这个程序在别的集群上计算完全可行的，没问题。可以排除程序问题。 问题： Q1：这个报错是什么意思？搞不明白 Q2: 是不是这台集群的MPI有问题？还是我哪里设置不对？ Q3：账号下面的“.bashrc”文件内容是： # .bashrc # User specific aliases and functions alias rm='rm -i' alias cp='cp -i' alias mv='mv -i' # Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi export MPI_CC=icc export MPI_F77=ifort export MPI_F90=ifort export MPI_CXX=icpc MPI_ROOT=/opt/hpmpi PATH=${MPI_ROOT}/bin:$PATH MANPATH=${MPI_ROOT}/share/man:$MANPATH LD_LIBRARY_PATH=${MPI_ROOT}/lib/linux_amd64:$LD_LIBRARY_PATH export LM_LICENSE_FILE=${MPI_ROOT}/licenses/license.dat:$LM_LICENSE_FILE export PATH MANPATH LD_LIBRARY_PATH export MPI_REMSH=/usr/bin/ssh 知道的大虾请帮忙啊~~大量金币赠送~~ 另外：我拷贝http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3389790这个帖子的源代码，然后在我的机子上编译可以，悲剧的是： [jiang1@node1 yang-2d]$ mpirun -np 4 ./matrix /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied 同样的问题啊！求解 [ Last edited by yjhqdm on 2012-9-6 at 19:03 ] |
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