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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

[求助] 这段话怎么理解?(来自MS帮助文件)

At present, you must check the Fix fractional position checkbox on the Atom tab of the Edit Constraints dialog in order to apply fixed atom constraints in CASTEP. This has the effect of fixing both fractional and Cartesian positions in a fixed cell calculation, and fixing Cartesian positions in a variable cell run. In the current version of Materials Studio, checking the Fix Cartesian position checkbox has no effect on CASTEP calculations.(这段话在castep部分)
第一句和第三句我能理解,就是说fix cartesian position复选框在我这个MS版本没有用,而固定原子一般用fix fractional position。
问题1:第二句是什么意思?fixed cell calculation和a variable cell run具体是指的什么情况?
问题2:关于分数坐标和笛卡尔坐标在晶胞表示中都有什么用处?怎样得出一个原子的分数坐标?
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喂人民服雾。
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
书万里: 金币+10 2012-08-30 15:53:08
xueht987: 金币+1, 鼓励交流! 2012-08-31 09:35:08
问题1. 直译:在你进行fixed cell calculation时,勾选Fix fractional position可以完全fix 原子 fratction和Cartesion都不发生变化。fixed cell calculation应该指固定原子坐标和晶格常数,a variable cell run指固定原子坐标,优化晶格常数。
问题2. 不清楚两者有什么比较特别的不同用处。都可以表示原子在晶格中的位置,可能不同领域或者个人有不同的选用喜欢。分数坐标就是0~1之间分数取值来表示晶胞中的原子坐标(有点归一化的意思),笛卡尔坐标值是0~(a,b,c) abc分别为晶格常数。关于笛卡尔坐标分数坐标的转换castep的help里面有好像介绍。原子分数坐标可从文献以及ICSD中获得,搞晶体的人基本的工作就是确定晶体结构以及原子坐标,做计算的人来做确定原子坐标的工作比较少见吧
从明天开始坚持吃早饭呀!
5楼2012-08-30 15:30:47
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seagrove

禁虫 (文坛精英)

小盼妞

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
书万里: 金币+5 2012-08-30 14:03:01
xueht987: 金币+1, 鼓励交流! 2012-08-31 09:34:47
第二个问题我的理解是:分数坐标是相对的 笛卡尔坐标是绝对的
要知道原子的坐标 需要查阅相关文献或者ICSD库
貌似做xrd精修也可以测出来 前提是你有比较纯的样品
我自己写坐标是查的文献
说出来和你讨论一下 不一定对哈
最近迷上林峰了,一直觉得人家过帅不值得迷来着……=_=!
2楼2012-08-30 13:10:53
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

引用回帖:
2楼: Originally posted by seagrove at 2012-08-30 13:10:53
第二个问题我的理解是:分数坐标是相对的 笛卡尔坐标是绝对的
要知道原子的坐标 需要查阅相关文献或者ICSD库
貌似做xrd精修也可以测出来 前提是你有比较纯的样品
我自己写坐标是查的文献
说出来和你讨论一下 不 ...

兄弟,太感谢你了,昨天也是你在顶我贴。
额,是了,一般向晶胞加原子用的就是用的笛卡尔坐标。
那分数坐标的大小事相对于什么呢?
哎,最近问题很多
喂人民服雾。
3楼2012-08-30 14:02:48
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seagrove

禁虫 (文坛精英)

小盼妞

优秀版主优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by 书万里 at 2012-08-30 14:02:48
兄弟,太感谢你了,昨天也是你在顶我贴。
额,是了,一般向晶胞加原子用的就是用的笛卡尔坐标。
那分数坐标的大小事相对于什么呢?
哎,最近问题很多...

我也是一肚子问题啊

我一般加原子用的是分数坐标呢
自己一个人摸索起来很痛苦啊
我就是想多和大家交流交流
ps. 我不是兄弟 哈哈
最近迷上林峰了,一直觉得人家过帅不值得迷来着……=_=!
4楼2012-08-30 15:13:00
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