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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

[求助] 这段话怎么理解?(来自MS帮助文件)

At present, you must check the Fix fractional position checkbox on the Atom tab of the Edit Constraints dialog in order to apply fixed atom constraints in CASTEP. This has the effect of fixing both fractional and Cartesian positions in a fixed cell calculation, and fixing Cartesian positions in a variable cell run. In the current version of Materials Studio, checking the Fix Cartesian position checkbox has no effect on CASTEP calculations.(这段话在castep部分)
第一句和第三句我能理解,就是说fix cartesian position复选框在我这个MS版本没有用,而固定原子一般用fix fractional position。
问题1:第二句是什么意思?fixed cell calculation和a variable cell run具体是指的什么情况?
问题2:关于分数坐标和笛卡尔坐标在晶胞表示中都有什么用处?怎样得出一个原子的分数坐标?
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喂人民服雾。
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书万里

木虫 (著名写手)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by seagrove at 2012-08-30 13:10:53
第二个问题我的理解是:分数坐标是相对的 笛卡尔坐标是绝对的
要知道原子的坐标 需要查阅相关文献或者ICSD库
貌似做xrd精修也可以测出来 前提是你有比较纯的样品
我自己写坐标是查的文献
说出来和你讨论一下 不 ...

兄弟,太感谢你了,昨天也是你在顶我贴。
额,是了,一般向晶胞加原子用的就是用的笛卡尔坐标。
那分数坐标的大小事相对于什么呢?
哎,最近问题很多
喂人民服雾。
3楼2012-08-30 14:02:48
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书万里

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引用回帖:
5楼: Originally posted by wzbhit at 2012-08-30 15:30:47
问题1. 直译:在你进行fixed cell calculation时,勾选Fix fractional position可以完全fix 原子 fratction和Cartesion都不发生变化。fixed cell calculation应该指固定原子坐标和晶格常数,a variable cell run指固 ...

谢谢兄弟你的详细回答。
对您的第一个回答还有疑问。fix cell calculation如果固定了原子坐标和晶格常数,那优化时什么是变量呢?如果晶格常数变了,原子坐标也不能固定了吧。
对于分数坐标还是不理解,分数坐标什么时候会成为1呢?
喂人民服雾。
6楼2012-08-30 15:53:00
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引用回帖:
4楼: Originally posted by seagrove at 2012-08-30 15:13:00
我也是一肚子问题啊

我一般加原子用的是分数坐标呢
自己一个人摸索起来很痛苦啊
我就是想多和大家交流交流
ps. 我不是兄弟 哈哈...

额,是我说错了,是用分数坐标建立晶胞。但是优化单分子的时候,往box里面添原子时,我用的是笛卡尔坐标。
哎,都是没法理解,都是依着创腾的教程依葫芦画瓢。
好吧,大妹子。
对了,你不是电化学的嘛,你现在用MS做电极表面?
喂人民服雾。
7楼2012-08-30 15:59:14
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引用回帖:
10楼: Originally posted by Joannaouc at 2012-08-30 21:45:12
只针对第一个问题:优化时你没有fix的原子坐标是变量。如果fix的是fractional,晶格变了原子绝对坐标会变。如果fix的是cartesian,晶格怎么变,原子绝对坐标都不会变。但是根据你刚开始贴的内容,castep好像不支持 ...

如果fix的是cartesian,晶格怎么变,原子绝对坐标都不会变。这句话中原子的绝对坐标是什么意思?
再问下,分数坐标和笛卡尔坐标的原点是重合的吧?
问题很弱智了吧,
喂人民服雾。
11楼2012-08-31 09:45:40
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引用回帖:
12楼: Originally posted by Joannaouc at 2012-08-31 10:51:06
这句话中绝对坐标=笛卡儿坐标
这个是不是重合完全看你自己。一般都设置为重合。程序给出来的也是重合。...

我还是想问,晶格变了,原子绝对坐标怎么会保持不变?可能我还是不知道,晶格优化是一个什么样的过程?
喂人民服雾。
13楼2012-08-31 16:53:47
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引用回帖:
14楼: Originally posted by Joannaouc at 2012-09-01 21:06:58
因为你勾选了原子绝对坐标不变、同时又要优化晶格的话,程序在的时候就是认为只是变了晶格,而不会让原子坐标变。这样计算出来一系列的单点能,找出来最低点就是计算出来的晶格常数。
简单来说,为什么会保持不变 ...

谢谢你了,前两天有点事没及时回你,不好意思。
喂人民服雾。
15楼2012-09-04 09:09:26
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引用回帖:
16楼: Originally posted by zicailili at 2012-09-04 09:27:01
分数坐标是直接坐标,是以基矢为单位的坐标.笛卡尔坐标是直角坐标.

关于分数坐标能否详细点?能否举个例子
喂人民服雾。
17楼2012-09-04 15:13:14
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