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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 药物设计的，大家说说一般都用DS其中的哪些模块
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gengheji

金虫 (小有名气)

[交流] 药物设计的，大家说说一般都用DS其中的哪些模块

如题，希望高手们多参与下，我刚接触，想尽快的全面了解下
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1楼 2012-08-25 14:12:29
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blue_cat

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+5, 谢谢 2012-08-27 09:11:13
可以用的模块很多啊，看你具体的工作情况了。有蛋白结构，可以做对接，里面对接有好几个模块，如果没有蛋白结构，可以做药效团，定量的和定性的。还可以做QSAR。还有ADMET性质的预测。还可以同源蛋白建模。如果已知化合物的体外活性，还可以去预测可能的作用靶标。基本上药物设计方法在DS中都可以实现。
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2楼2012-08-27 08:40:21
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ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-29 10:38:04
呵呵 是不是要买DS啊 》》》个人觉得DS要买的话还是买全套的吧 所有组件  对接 同源模建 药效团 分子动力学 AMDET预测 QSAR模型的建立  等等  所有的组件买的话比只买其中的几个模块要好 没准什么模块以后会用上  可以和创腾谈谈价嘛
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3楼2012-08-29 00:39:45
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倩430

铁虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-08-31 19:45:49
ds里面有好多模块，处理蛋白体系有着不错的优势。建立药效团，虚拟筛选，同源模建，分子对接，分子动力学等等。
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4楼2012-08-31 19:11:23
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blue_cat

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-09-04 17:37:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by ts2009 at 2012-08-29 00:39:45
呵呵 是不是要买DS啊 》》》个人觉得DS要买的话还是买全套的吧 所有组件  对接 同源模建 药效团 分子动力学 AMDET预测 QSAR模型的建立  等等  所有的组件买的话比只买其中的几个模块要好 没准什么模块以后会用上 ...

但是DS的对接是比较烂的，这个创腾的工程师也承认
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5楼2012-09-03 23:14:20
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ts2009

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by blue_cat at 2012-09-03 23:14:20
但是DS的对接是比较烂的，这个创腾的工程师也承认...

这个看个人的要求怎样  不然你再买个薛定谔吧
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6楼2012-09-04 15:19:54
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gengheji

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by blue_cat at 2012-09-03 23:14:20
但是DS的对接是比较烂的，这个创腾的工程师也承认...

对接比较烂，这个也知道，我知道药效团还好，就是想问下这几个模块里相对来说做得比较好的
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7楼2012-09-06 15:37:59
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