24小时热门版块排行榜    

查看: 1750  |  回复: 10

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] MuSic post处理结果出错


看下面第一个图最后两行:Species is not big enough to read the information in the datafile, The calling program shoud allocate more memory for species structre.
这是什么意思呢?如何克服?这个例子是CH4在IRMOF1上吸附的例子。
下面这个图中Age of datafile这一部分是否应该保留呢?看ghcacj的连载文档上没有提到这部分。



@ghcacj

[ Last edited by cenwanglai on 2012-8-15 at 23:45 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

重新设置了post.ctr,重新跑了一遍。
得到下面的结果~。提示说误差太大~


2楼2012-08-16 00:03:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★
uuv2010: 金币+1, 欢迎讨论 2012-08-17 15:42:23
没用过这个不过打算学,这个软件主要是用来做那些计算的?
心之所向无惧无悔
3楼2012-08-16 10:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by sunyang1988 at 2012-08-16 10:12:09
没用过这个不过打算学,这个软件主要是用来做那些计算的?

经验力场MD, MC.
吸附,扩散。
4楼2012-08-16 10:20:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★
uuv2010: 金币+1, 欢迎讨论 2012-08-17 15:42:30
引用回帖:
4楼: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-16 10:20:01
经验力场MD, MC.
吸附,扩散。...

经验力场势函数从哪里来,难不难上手
心之所向无惧无悔
5楼2012-08-16 11:20:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by sunyang1988 at 2012-08-16 11:20:06
经验力场势函数从哪里来,难不难上手...

我知道可以参考发表的文献。

没有力场参数的,自己如何生成参数,这个套路我不清楚~
6楼2012-08-17 15:32:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cenwanglai: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 嗯。直接删掉之即可。 2012-08-20 12:49:33
引用回帖:
2楼: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-16 00:03:00
重新设置了post.ctr,重新跑了一遍。
得到下面的结果~。提示说误差太大~
3e/ae/537452_1345046532_855.png

这里误差太大,是指Music程序对你的吸附等温线拟合误差太大,这个是正常的,话说我做了这么多条等温线,似乎每一次说误差不大的。因为它采用的Langmuir等温线,对于很多吸附剂,都不是很适合。
你只要关注你做出的吸附量与文献中相同的例子是否吻合即可。
至于那个Age of data,这个是已经废弃掉的选项,在老版本的Music中使用过,最新的4.0版本已经不再使用它了。
7楼2012-08-20 12:45:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
7楼: Originally posted by ghcacj at 2012-08-20 12:45:45
这里误差太大,是指Music程序对你的吸附等温线拟合误差太大,这个是正常的,话说我做了这么多条等温线,似乎每一次说误差不大的。因为它采用的Langmuir等温线,对于很多吸附剂,都不是很适合。
你只要关注你做出的 ...

最近看了一些QM/MM的文章。

MuSic现在也能跑起来。希望都能用上~。
8楼2012-08-20 12:50:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunbc0210

新虫 (初入文坛)

楼主那个not big enough to read the information in the datafile的問題是怎麼解決的?
9楼2014-05-09 16:46:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunbc0210

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sunbc0210 at 2014-05-09 16:46:06
楼主那个not big enough to read the information in the datafile的問題是怎麼解決的?

搞定了,我算得是MIL101, 將近1w個吸附分子。一是增加構形數目config.file, 二是修改src/defaults.F90第154行 INITIAL_SIZE = 3000(改爲20000).
10楼2014-05-10 15:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”:确已离世,正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见