24小时热门版块排行榜    

查看: 1386  |  回复: 10

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] MuSic post处理结果出错


看下面第一个图最后两行:Species is not big enough to read the information in the datafile, The calling program shoud allocate more memory for species structre.
这是什么意思呢?如何克服?这个例子是CH4在IRMOF1上吸附的例子。
下面这个图中Age of datafile这一部分是否应该保留呢?看ghcacj的连载文档上没有提到这部分。



@ghcacj

[ Last edited by cenwanglai on 2012-8-15 at 23:45 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

重新设置了post.ctr,重新跑了一遍。
得到下面的结果~。提示说误差太大~


2楼2012-08-16 00:03:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)


uuv2010: 金币+1, 欢迎讨论 2012-08-17 15:42:23
没用过这个不过打算学,这个软件主要是用来做那些计算的?
心之所向无惧无悔
3楼2012-08-16 10:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by sunyang1988 at 2012-08-16 10:12:09
没用过这个不过打算学,这个软件主要是用来做那些计算的?

经验力场MD, MC.
吸附,扩散。
4楼2012-08-16 10:20:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)


uuv2010: 金币+1, 欢迎讨论 2012-08-17 15:42:30
引用回帖:
4楼: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-16 10:20:01
经验力场MD, MC.
吸附,扩散。...

经验力场势函数从哪里来,难不难上手
心之所向无惧无悔
5楼2012-08-16 11:20:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by sunyang1988 at 2012-08-16 11:20:06
经验力场势函数从哪里来,难不难上手...

我知道可以参考发表的文献。

没有力场参数的,自己如何生成参数,这个套路我不清楚~
6楼2012-08-17 15:32:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cenwanglai: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 嗯。直接删掉之即可。 2012-08-20 12:49:33
引用回帖:
2楼: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-16 00:03:00
重新设置了post.ctr,重新跑了一遍。
得到下面的结果~。提示说误差太大~
3e/ae/537452_1345046532_855.png

这里误差太大,是指Music程序对你的吸附等温线拟合误差太大,这个是正常的,话说我做了这么多条等温线,似乎每一次说误差不大的。因为它采用的Langmuir等温线,对于很多吸附剂,都不是很适合。
你只要关注你做出的吸附量与文献中相同的例子是否吻合即可。
至于那个Age of data,这个是已经废弃掉的选项,在老版本的Music中使用过,最新的4.0版本已经不再使用它了。
7楼2012-08-20 12:45:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
7楼: Originally posted by ghcacj at 2012-08-20 12:45:45
这里误差太大,是指Music程序对你的吸附等温线拟合误差太大,这个是正常的,话说我做了这么多条等温线,似乎每一次说误差不大的。因为它采用的Langmuir等温线,对于很多吸附剂,都不是很适合。
你只要关注你做出的 ...

最近看了一些QM/MM的文章。

MuSic现在也能跑起来。希望都能用上~。
8楼2012-08-20 12:50:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunbc0210

新虫 (初入文坛)

楼主那个not big enough to read the information in the datafile的問題是怎麼解決的?
9楼2014-05-09 16:46:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunbc0210

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sunbc0210 at 2014-05-09 16:46:06
楼主那个not big enough to read the information in the datafile的問題是怎麼解決的?

搞定了,我算得是MIL101, 將近1w個吸附分子。一是增加構形數目config.file, 二是修改src/defaults.F90第154行 INITIAL_SIZE = 3000(改爲20000).
10楼2014-05-10 15:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 326求调剂 +3 上岸的小葡 2026-03-15 4/200 2026-03-15 18:50 by 无际的草原
[考研] 321求调剂 +3 大米饭! 2026-03-15 3/150 2026-03-15 17:48 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 293求调剂 +5 上班不着吉 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:37 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +14 王晓阳- 2026-03-09 19/950 2026-03-14 02:05 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 327求调剂 +4 Ffff03 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:17 by JourneyLucky
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 一志愿:武汉理工,材料工程,英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
请填处理意见