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xyz7819227

木虫 (正式写手)

[求助] 关于二面角扫描的结果，大神进来帮忙看一下

我对一个分子进行了二面角扫描，扫了六步之后，我就把它停了，然后拿出out文件来看，结果如下图所示，我想问的是能量扫描那幅图里面最低点表示的是在当期二面角下分子的能量最低，结构最稳定吗？   然后下一张显示出来的是什么呢？RMS梯度是什么意思？表示的什么？  知道的大神帮忙回答一下啊，不胜感激





[ Last edited by xyz7819227 on 2012-8-14 at 14:55 ]
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海纳百川，有容乃大
1楼 2012-08-14 14:54:00
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-08-17 17:22:07
结构如图所示，二面角扫描有意义吗？
85/8b/1487909_1345195295_162.jpg
...

这样的结构应该得到的就是不规律的
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xyz7819227
9楼2012-08-17 22:33:31
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xyz7819227: 金币+1, ★有帮助 2012-08-15 13:31:41
scan可以做出来能量的相对比值，但是无法判断其是否为最稳定状态，对于你这种情况。rms是能量均方根，可以查看一下高斯说明书。均方根越小，说明这个结构相对越稳定
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2楼2012-08-15 10:34:05
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xyz7819227

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-15 10:34:05
scan可以做出来能量的相对比值，但是无法判断其是否为最稳定状态，对于你这种情况。rms是能量均方根，可以查看一下高斯说明书。均方根越小，说明这个结构相对越稳定

那我想问一句，为什么看别人的文章做势能面扫描，出来的结果都是很漂亮的弧线，而我的却是这么难看的折线呢？
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海纳百川，有容乃大
3楼2012-08-15 15:07:32
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
xyz7819227: 金币+1, ★有帮助 2012-08-16 10:48:00
引用回帖:
3楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-08-15 15:07:32
那我想问一句，为什么看别人的文章做势能面扫描，出来的结果都是很漂亮的弧线，而我的却是这么难看的折线呢？...

结构不好，或者是取坐标scan的跳跃太大了
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4楼2012-08-16 10:02:31
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