24小时热门版块排行榜    

查看: 1274  |  回复: 9

xyz7819227

木虫 (正式写手)

[求助] 关于二面角扫描的结果,大神进来帮忙看一下

我对一个分子进行了二面角扫描,扫了六步之后,我就把它停了,然后拿出out文件来看,结果如下图所示,我想问的是能量扫描那幅图里面最低点表示的是在当期二面角下分子的能量最低,结构最稳定吗?   然后下一张显示出来的是什么呢?RMS梯度是什么意思?表示的什么?  知道的大神帮忙回答一下啊,不胜感激





[ Last edited by xyz7819227 on 2012-8-14 at 14:55 ]
回复此楼
海纳百川,有容乃大
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xyz7819227: 金币+1, 有帮助 2012-08-15 13:31:41
scan可以做出来能量的相对比值,但是无法判断其是否为最稳定状态,对于你这种情况。rms是能量均方根,可以查看一下高斯说明书。均方根越小,说明这个结构相对越稳定
2楼2012-08-15 10:34:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-15 10:34:05
scan可以做出来能量的相对比值,但是无法判断其是否为最稳定状态,对于你这种情况。rms是能量均方根,可以查看一下高斯说明书。均方根越小,说明这个结构相对越稳定

那我想问一句,为什么看别人的文章做势能面扫描,出来的结果都是很漂亮的弧线,而我的却是这么难看的折线呢?
海纳百川,有容乃大
3楼2012-08-15 15:07:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


xyz7819227: 金币+1, 有帮助 2012-08-16 10:48:00
引用回帖:
3楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-08-15 15:07:32
那我想问一句,为什么看别人的文章做势能面扫描,出来的结果都是很漂亮的弧线,而我的却是这么难看的折线呢?...

结构不好,或者是取坐标scan的跳跃太大了
4楼2012-08-16 10:02:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-16 10:02:31
结构不好,或者是取坐标scan的跳跃太大了...

你是什么结构啊,看一眼不就好了。如果一样那你的基组一直么
5楼2012-08-16 11:53:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-16 11:53:15
你是什么结构啊,看一眼不就好了。如果一样那你的基组一直么...

额。。。什么意思啊?没看懂     是说看我优化的分子的结构吗?
海纳百川,有容乃大
6楼2012-08-16 20:05:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-08-16 20:05:56
额。。。什么意思啊?没看懂     是说看我优化的分子的结构吗?...

问你结构对称性好不好啊,如果好的话,应该就很规则了。把结构发出来啊
7楼2012-08-17 10:52:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-17 10:52:27
问你结构对称性好不好啊,如果好的话,应该就很规则了。把结构发出来啊...

结构如图所示,二面角扫描有意义吗?


海纳百川,有容乃大
8楼2012-08-17 17:22:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-08-17 17:22:07
结构如图所示,二面角扫描有意义吗?
85/8b/1487909_1345195295_162.jpg
...

这样的结构应该得到的就是不规律的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2012-08-17 22:33:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyz7819227

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-08-17 22:33:31
这样的结构应该得到的就是不规律的...

方便加个QQ不,以后能多请教啊
我的371856755
海纳百川,有容乃大
10楼2012-08-18 10:02:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xyz7819227 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +12 不知道叫什么! 2026-03-15 14/700 2026-03-16 16:45 by 我的船我的海
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +7 曦熙兮 2026-03-15 7/350 2026-03-16 16:34 by houyaoxu
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 304求调剂 +6 小熊joy 2026-03-14 6/300 2026-03-16 12:59 by Iveryant
[考研] 268求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-14 6/300 2026-03-14 22:20 by 运气yunqi
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 一志愿华中农业大学071010,总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
信息提示
请填处理意见