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十三-小样

铜虫 (小有名气)

[求助] 求有经验的虫子帮忙设计简并引物

我想扩增一种鱼GABAa受体β3亚基。没设计过简并引物,求有经验的虫子帮忙设计下。能把过程截屏更好了,网上虽然帖子很多,但没实战经验不敢付诸行动。合成引物怕烧钱。。。根本帮不上忙,只有靠自己那查查这问问。我下载了其他物种的GABAaβ3亚基蛋白质序列,鱼类的不够,我拿哺乳动物的补上的。放在TXT里面。里面的有的序列前面有PREDICTED字样,但有的朋友说预测的基本正确,也可以用来设计引物。求帮忙。我自己也试试,就怕不靠谱。希望有这经验,本子里也有序列比对,引物设计,引物优化软件的朋友帮帮忙。如果可以截下屏。对我是莫大的帮助。谢谢。
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  • 附件 1 : 寻找保守区的多物种GABAβ3亚基含有鲍鱼钉螺.txt
  • 2012-08-07 18:52:57, 4.58 K

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fengyunqb

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 至少给一个EPI,鼓励鼓励 2012-08-09 14:21:06
结果已经截屏。











3楼2012-08-08 15:58:26
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普通回帖

fengyunqb

新虫 (小有名气)

用CLUSTAL X,PP5.0,OLIGO即可。
2楼2012-08-08 09:23:03
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fengyunqb

新虫 (小有名气)

4楼2012-08-08 16:00:05
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poog502

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
十三-小样: 金币+1, 谢谢回帖 2012-08-11 10:52:12
设计兼并引物还是有一定难度,其实在线的genefisher是不错选择
具体参考http://liucheng.name/980/
5楼2012-08-09 09:29:02
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fengyunqb

新虫 (小有名气)

6楼2012-08-09 11:45:52
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